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为什么需要探针重注释有的同学可能认为easyGEO能解决所有预处理的问题了,直到遇到了一些平台根本就没有提供探针与基因的对应关系。以数据GSE156144为例: GPL16956平台注释文件可以发现,平台的注释文件没有提供探针与基因的对应关系,但是提供了探针的序列。这种情况就需要根据探针序列把探针转换为基因,这个过程就是我们常说的探针重注释了。重注释的思路有了探针的序列,我们可以使用序列比对软件(

  • 什么是探针重注释?

    什么是探针重注释?

    网友投稿 2025-03-29 10:11:08

    为什么需要探针重注释有的同学可能认为easyGEO能解决所有预处理的问题了,直到遇到了一些平台根本就没有提供探针与基因的对应关系。以数据GSE156144为例: GPL16956平台注释文件可以发现,

  • Rosalind,一个在线学习生信的网站 ​

    Rosalind,一个在线学习生信的网站 ​

    网友投稿 2025-03-29 09:57:08

    做生物信息学需要三类技能:生物学知识、统计学知识、编程能力。我们在学习生物信息学时,有很大一部分内容是学习解决特定的问题。基础的序列比对、相关格式文件的处理、数据统计和可视化等等。这些问题往往需要编程

  • 细菌完成图组装软件简单介绍

    细菌完成图组装软件简单介绍

    网友投稿 2025-03-29 09:44:08

    最近看了两篇三代测序数据用于细菌完成图组装的软件,一个是AHA,一个是HGAP。这两个软件中AHA是采用的混合拼接的方法,HGAP则是完全利用的唇三代数据。AHA 的文章A Hybrid Approa

  • 泛癌蛋白激酶预后分析

    泛癌蛋白激酶预后分析

    网友投稿 2025-03-29 09:30:08

    大家好,今天是周二,给大家分享生信科研思路的日子。不知道小伙伴们有没有发现最近杂志生信思路文章寥寥无几,看到其它公众号都开始分享去年前年的文章了。小编也是比较愁,是不是大家都忙着国自然的事情没工夫投稿

  • 开放阅读框(ORF)预测

    开放阅读框(ORF)预测

    网友投稿 2025-03-29 09:17:08

    编码区(Coding Sequence,CDS) :mRNA分子中能翻译成多肽的那部分序列。正反向两条链就有6种读码框架。ORF 开放阅读框(Open reading frame, ORF):基因序列

  • 物种拉丁名WORD中报错怎么办

    物种拉丁名WORD中报错怎么办

    网友投稿 2025-03-28 15:48:08

    最近小编在英语论文写作时遇到了一个问题,论文包含很多拉丁文物种名,这些以拉丁文命名的物种名对生物学家有多重要我们在之前的推文已有所介绍,然而,它们中的大部分在WORD校验中都被标出“错误”: 如下面的

  • 轻松解决GEO数据预处理

    轻松解决GEO数据预处理

    网友投稿 2025-03-28 15:35:08

    为什么需要预处理GEO平台上的数据主要可以分为两大类:传统的microarray数据近几年比较流行的高通量测序数据对于microarray数据,官网上一般给出的是探针的表达值。而我们执行分析时一般需要

  • 一图看懂CRISPR的今生前世

    一图看懂CRISPR的今生前世

    网友投稿 2025-03-28 15:21:08

    今天,CRISPR专利权的诉讼终于尘埃落定,Broad研究所的张锋还是笑到了最后:美国专利及商标局判定,张锋和Broad研究所将继续持有在2014年获得的CRISPR-Cas9专利技术,专利应用范围包

  • tophat中的mate-inner-dist 啥意思

    tophat中的mate-inner-dist 啥意思

    网友投稿 2025-03-28 15:07:08

    Tophat中mate-inner-dist的介绍随着转录组项目的火爆,tohat软件的应用也越来越多,但是对于tophat中角落的一个参数mate-inner-dist这个参数默认是(50),你了解

  • 找了两年的预后marker+分子对接的思路,它来了

    找了两年的预后marker+分子对接的思路,它来了

    网友投稿 2025-03-28 14:54:08

    19年我们在北京做分子对接培训的时候,就有很多客户问我们,临床生信就是找各种marker的,学习这个有啥用。小编从那时就开始找生物信息筛选marker和分子对接的思路。终于找到了,bia给大家。给大家