大家好，今天是周二，给大家分享生信科研思路的日子。不知道小伙伴们有没有发现最近杂志生信思路文章寥寥无几，看到其它公众号都开始分享去年前年的文章了。小编也是比较愁，是不是大家都忙着国自然的事情没工夫投稿了。在不断的苦苦寻求下，小编终于找到了灯火阑珊下的新点子——蛋白激酶。

蛋白激酶（protein kinases，简称PK），是催化蛋白质磷酸化过程的酶。癌基因对抑癌基因失活的激活过程中蛋白激酶起了重要的作用。很多激酶作为药靶的抑制剂已获得FDA批注，但是很大一部分潜在功能尚未得到研究证实。

最近在cancer 上发表了一篇泛癌蛋白激酶相关的文章。文章结合蛋白激酶编码基因的甲基化数据和表达数据阐述了蛋白激酶作为癌症预后和诊断marker的功能。

人类激酶基因表达和甲基化的泛癌分析识别多癌中机制尚未明确的激酶marker

分析数据集：

TCGA 32种癌型 表达、甲基化数据、

分析方法：

t-SNE聚类、差异分析、甲基化数量性状位点分析（meQTL）、生存分析

主要结果

1、激酶基因表达和甲基化β值对泛癌进行聚类，发现激酶足以区分癌症类型

2、激酶基因在泛癌中的差异表达

3、激酶基因包含的差异甲基化位点泛癌展示

4、激酶基因表达与甲基化在泛癌中相关性展示

5、激酶基因与相关甲基化位点泛癌生存分析展示

6、泛癌中普遍与生存相关的激酶基因和甲基化位点在单个癌症中预后分析

至此，该篇文章分享就结束了。文章从对TCGA 32癌型中蛋白激酶的表达和甲基化数据进行了差异、相关性、生存等分析，尤其是分析了机制尚未明确的激酶（dark kinases）。结果告诉我们激酶基因对泛癌预后有重要的影响，那么我们是否能聚焦单个特殊癌症或者癌症特殊亚型对激酶进行分析呢？当然啦！如果你对蛋白激酶肿瘤分析感兴趣，扫描右方二维码联系我们制定细节方案吧。