Tophat
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转录组数据比对工具(一)
主要的比对工具如下,他们各有自己的特点,本节主要讲tophat2.•Tophat:可以实现断点比对(splicing-aware aligner),用来比对基因组。主要是通过控制内含子长度来实现,默认
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怎么获取unique read?
在NGS数据中,Unique reads指的是只能map到一个位置的reads。要判断一条read是否unique,需要看SAM文件的optional fields。optional fields的格
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一个很有趣的de novo图论算法
首先,小编先给大家介绍一些关于组装的历史。大家肯定也知道,这个组装技术的发展是依赖于测序技术的。首先在一代测序的时候,测序数据量较少,成本较高,人们对于组装的结果预期也比较低,弄到contig水平就可
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如何快速的做生信分析
好多人想去做某一项分析,但是不知道有没有现成的软件可以做,或者有好多软件,我不知道如何选择哪一个软件。只有解决这两个问题,我么才可以迅速分析,得到想要的结果。那么如何解决这个问题呢?小编主要推荐一个一
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