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1、利用jModelTest建模,记录如输出的结果 2、将利用Dnasp输出的.nex数据转化为txt格式()。其中111为个体数,334为最长序列碱基对数(bp)。 3、打开PhyML软件,在DOS中输入刚才保存的文件名,如最后一行。回车 4、回车后出现如所示界面,这里面需要注意的是[I]项,因为我们用的是sequential,因此在光标处输入I,然后回车,会发现[I]项后的interlea变为