行业观点
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基于ATAC-seq和RNA-seq预测子宫内膜非典型增生和子宫内膜样癌患者黄体酮不敏感的潜在模型
基于ATAC-seq和RNA-seq预测子宫内膜非典型增生和子宫内膜样癌患者黄体酮不敏感的潜在模型子宫内膜样癌(EEC)是妇科最常见的恶性肿瘤之一,每年新发癌症病例和死亡人数呈上升趋势。值得注意的是,
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如何快速掌握TCGA数据库?推荐一个快速易上手的!
如何快速掌握TCGA数据库?推荐一个快速易上手的!参加培训班——最快速的方法(见下文)。有些生物信息公司会针对高校教师和医师开生信培训班,我导师带着我上过几次,有TCGA、Oncomine和R的。上手
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新鲜热乎的10+生信思路确定不来看看?
新鲜热乎的10+生信思路确定不来看看?都2021年了,想必新鲜热乎的10+生信思路也不好找了。其实不然,只要有足够的数据量,就没有生信玩不转的。当然,小编此次要分享的这篇文章主要卖点是自己测的几百例临
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单细胞测序如何在骨科疾病中应用?骨医人必须知道
骨关节炎(OA)是一种非常普遍的,与年龄相关的关节疾病,其特征在于软骨退化,活动性丧失和慢性疼痛。OA的病因非常复杂。然而,直至今天也没有用于治疗OA的药物,在单细胞水平上理解该组织可以发现更深层次的
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一文带你寻找有害的同义突变
咚咚咚,您的生信早餐已送达,请及时享用~~~嘻嘻,朋友们,好久不见吖,小编最近在做遗传突变相关的课题,看了一些这方面的文章之后,发现在筛选疾病相关的突变位点时,大家基本上都会选择过滤掉同义突变,这样看
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泛基因组(Pangenome)测序知多少
一、什么是泛基因组?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念(pangenome,pan源自希腊语‘παν’,全部的意思),泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年,Li等人首次
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在线同源蛋白文献搜索小工具——PaperBLAST
BLAST的家族有诸多成员,按照比对序列来分,包括最原始的no gapped BLAST(1),到后来支持空位比对的gapped BLAST(2),再到后来旨在搜索远源同源蛋白的位点特异性矩阵PSI-
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结构生物信息学系列之分子对接(二)
AutoDock Vina(以下称为Vina)是最为常用的免费的分子对接软件。和之前的版本AutoDock 4相比,Vina的对接精度更高,且支持多核机器进行并行计算。我们选取KIT蛋白和suniti