IGEM2024专访 | BNUZH-China团队四年四金四提名，首创前十新佳绩！

2024-11-06 发布

BNUZH-China团队获奖速览

2024年10月22日至26日，第二十一届国际遗传工程机器大赛中北京师范大学珠海校区的BNUZH-China团队连续第四年斩获金牌，并首次获得Best Bioremediation Project赛道单项奖和Best Model, Best Integrated Human Practices,Best Wiki特殊单项奖共四项单项奖提名！
在本次比赛中，衍因智研云为北京师范大学珠海校区的BNUZH-China团队提供了全方位的工具支持，从团队协作、任务规划和分发，到实验设计、质粒构建，同时系统中内置多种iGEMer专属Protocol模板，一键生成实验记录，帮助团队全流程数据留存和管理，助力最终Wiki Freeze提交。

BNUZH-China团队巴黎合照

赛后，我们对BNUZH-China团队的同学们进行了专访，让我们更清楚地了解到他们团队组成分工以及项目经验。

以下是本次接受采访的BNUZH-China团队成员：
李梓熙北京师范大学文理学院生物科学 2022级郑雯丹北京师范大学文理学院生物科学 2022级
蒋思妍北京师范大学文理学院生物科学 2022级
廖俊杰北京师范大学文理学院数据科学与大数据技术 2023级
曹浩博北京师范大学文理学院生物科学 2023级

请简要介绍你们的项目主题是什么？

郑雯丹（实验）：
微塑料污染的全球性问题已成为海洋和沿海生态系统面临的重大挑战。研究表明，红树林不仅能有效阻挡塑料碎片，还会逐渐将其积累在土壤和沉积物中。因此，红树林土壤中的微塑料含量明显高于其他海岸线或其他海洋沉积物。而PE微塑料是其中最难降解且在部分区域分布最多的微塑料。
为了解决这些问题，BNUZH-China团队提出了“Mangroves PE&CO2 Hunters”项目

该项目设计了两种不同的工程细菌来应对这一环境挑战。第一种是铜绿假单胞菌（P. aeruginosa），它经过基因改造，能更有效地分解PE微塑料。此外，团队还设计了工程化沼泽红假单胞菌（R. palustris）来固定塑料降解过程中产生的二氧化碳。

你们的团队是如何组建和分工的？

李梓熙（HP）：
我们的团队在校内本科生中广泛招募，包括师范生和非师范生，一共有四种专业，分别是生物科学、心理学、数据科学与大数据技术（下称大数据）、人工智能。实验组均为生物科学专业，从6月到暑假，直到wiki freeze前一刻还在赶工实验；建模组中生物科学占比2/3，大数据的同学占1/3，主要负责了今年的PEBP结合肽预测、潮汐冲刷模型、代谢网络等等模型设计；而HP的背景比较多元，有生物科学、心理学和大数据三个专业，在开展人类实践的过程中通过学科交叉进行更广的思考；美工组均为生物科学专业，主要负责的是科研绘图以及队伍的周边、文创设计；Wiki组术业有专攻，主要为大数据和人工智能专业的同学，负责网页的设计和代码编写。

BNUZH-China团队合照

你们的项目有哪些独特的创新之处？

郑雯丹（实验）：
1.降解通路创新 2.双菌系统创新 3.因地制宜的课题背景创新廖俊杰（建模）：
其实建模做的也没有很创新吧，都是在用一些比较常见的方法来做，做的比较全面，数学建模，蛋白建模和深度学习都cover了。不过，可能如果说比较有新意的地方就是follow up了目前rag技术的进展，提出相关概念模型，也实现了demo，不过效果实际一般，有改进的空间。产生的话我觉得就是要多和做实验的同学交流，了解wetlab遇到的问题，然后再对应查文献找不同领域的方法，迁移学习，这样就比较有意思。还有就是多思考怎么将目前不断涌现的AI的模型迁移应用。李梓熙（HP）：
今年的HP提出了全新的iHP tRi-Cycle框架和三重底线模型，并且采用了双线时间轴来完整记录了iHP的开展过程，从3月、4月左右的初步提出，到交流会上的灵感迸发和队内讨论，所有的新想法都离不开多元的视角和接触到的不一样的思维。

在比赛中遇到了哪些挑战以及如何克服？

郑雯丹（实验）：
1.项目设计之初构思探索创新且可行的方向。
解决方法：疯狂看文献，找文献，精读重要文献，找、学、想。先出宏观概念，再确定实施细节。CCiC之后运用到了衍因智研云的AI文献助手进行快速梳理，减少了寻找关键文献的时间。
2.实验过程中时间紧，经常失败，且在载体构造之初由于缺乏经验埋下了很多雷导致分子实验进展缓慢。
解决方法：
利用衍因智研云的实验记录功能，每日召开小型组会，缩短时间进度和沟通成本，以最节约时间成本的方式重构载体，筛选多个启动子元件；学习专业设计引物的方法，控制变量找出实验中出错的环节，重复实验，对比文献或咨询友队优化实验方法。
3.临近wiki freeze时发现要写的wiki还有很多，且Home页面叙述几乎要重做。
解决方法：负责人承担更多，同时鞭策组员写与审；召集效率最高的成员共同以最短时间完成重构。

与其他团队或机构的合作经历如何？

蒋思妍（HP）：
在华南交流会、CCiC、iGBA以及华中交流会上，我们很高兴能和很多团队进行深度交流，探讨合作的可能，这是非常宝贵的机会，去探讨实验进度、目前工作和遇到的瓶颈，我们收获了很多来自友队的启发，比如硬件的生物膜设计就受到了来自深大团队的硬件设计初稿启发。
我们除了与衍因校园大使的密切合作之外，也与其他多支队伍有合作。比如我们与吉林大学基础医学院团队开展了分别面向全国高中生和大学生的iBSRC课程（iGEM生物医学科学研究课程），在直播课中，尤其是面向已有一定生物背景的近三百名大学生的这部分内容，我们一方面要基于学情，一方面要拓展合成生物学这个新兴学科和介绍自己的项目，也是有一定的挑战性。当然，最后学生的反响还是非常好的，对我们项目可以说是在合作和教育两方面都有帮助，既是友队之间的合作，又是对合成生物学的科普教育、对自己项目的复盘宣传，还能够在更大的舞台上帮助吉大团队一同宣传我们衍因智研云的工具，非常有意义。
李梓熙（HP）：
非常幸运能在CCiC能够遇到衍因科技，才有了我们后面的这么多故事和今天的采访。衍因智研云这个数字化的分子生物学工具相当智能、全面和便捷，使得我们实验记录的效率大幅提升，方便了团队管理。以及我们和澳门大学、香港科技大学以及南方科技大学共同举办的iGBA，作为我们大湾区各队伍的一次产学研交流盛会，正是在衍因、泓迅、贝湾等国内知名合成生物学相关企业支持下，才能推动我们顺利开展本年的活动并准备下一年的计划，走向更光明的未来。

衍因实验记录

这次比赛的收获是什么？

郑雯丹（实验）：
在做IGEM项目之前，我没有想到过我可以做一个完整的项目出来。被IGEM认可也极大地提高了我的学术自信，在未来的学术研究中会更有动力去完成。
曹浩博（硬件）：
参加这次比赛学到了很多，刚参加这个项目的时候我还是大一，因为师范生的身份之后打算回高中当老师，没有想到自己能够参与到这么多比较前沿的项目。通过加入IGEM这个项目，我学到了3D建模、电路设计以及合成生物学的基本操作，所以这是我在整个比赛周期收获最大的一点，就是学会了很多新知识。

衍因智研云亮点一览

实验记录与数据留存：确保科研成果得以妥善保存与传承，避免学生毕业后资料散失。
知识共享无缝对接：构建团队知识库，打破信息孤岛，促进团队间的知识交流与创新。
随时随地指导实验：通过移动设备即可随时查看实验进度，实时指导学生课题推进。
AI工具辅助科研工作：使用AI工具，快速浏览科研资料，高效压缩知识检索时间。
资源协调智能化：智能设备预约与维护跟踪，确保实验设备高效运行。
物资管理透明化：高效库存管理与物料监控，减少浪费，提升资源利用率。