基因组组装
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BUSCO:基因组组装完整性评估
简单介绍基因组组装还在狂热的追求N50大小吗?NO,N50越大BUSCO说并不一定越好!还在使用CEGMA做基因组组装完整性评估吗?NO,CEGMA自己说BUSCO已经把我踢走了!呵呵,今天小编先给你
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最全、最干的生信干货强势来袭
鉴于大家对这份资料的热情,故有需要的仍可以留言赞赏后获取主要内容如下:就是word版已测序动植物基因组大全(物种名中英文对照)不仅仅如此小编还通宵达旦整理过去这几个月的浏览量上千的技术文章、生信资源、
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NCBI原始数据极速下载
今天教一下大家如何更加快速的(可都是Mb/s的速度奥)下载NCBI数据,包括转录组、基因组原始数据SRA文件和基因组组装及注释数据(genome和GFF文件),还有其他NCBI上所有数据大家自己发挥,
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基因组测序基本原理讲解
首先简单的说一下二代测序技术,一般简称给NGS,新一代测序技术。原理基本如下,将基因组序列采用鸟枪法打碎——俗称建库,然后采用凝胶电泳的方式将不同长度的片段分离,比如现在建库,短库一般建180bp,2
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如何利用测序数据判断基因组倍性
ploidyNGS:可视化探索基因组倍性了解一个物种或者细胞的基因组的倍性,在进化、群体、基因组研究上有重要的意义。比如组装多倍体物种的基因组,需要了解它的倍性,评估组装的难度。但是,怎样检测或者推算
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Hi-C辅助基因组组装现状
2017年3月23日Science发表利用Hi-C完成传播寨卡病毒和西尼罗病毒的两种蚊虫的3条染色体序列的组装。2017年4月27日Nature发表利用Hi-C完成大麦基因组的组装,并阐明大麦染色体的
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