行业观点
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RepeatMasker软件介绍
RepeatMasker是一款用于寻找DNA序列中中间重复序列和低复杂度DNA序列的软件。这个软件的输出是对其中重复序列的碱基进行标注,默认的是改为N。目前56%的人类基因组重复序列的标注用的是这个工
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超前一小步,SCI一大步
大家早上好!继上周肿瘤微环境相关的乳酸代谢思路一经推出受到了大家的广泛关注。依循一个热点出现后的发文规律(见副推),生信人自然而然想到了结合上另一个热点:lncRNA。对啦,这期的主题是乳酸+lncR
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地球上现存的简单生物都有哪些
地球经过10亿年的“化学进化”使得一些有机大分子团的形成。再用25亿年使得这些有机大分子团能够“偶然”的结合和发生反应,整个25亿年里地球上只有看不见的“生物”。而在这35亿年,地球上生物的产生是如此
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Hi-C辅助基因组组装
1、什么是Hi-C组装? Hi-C辅助基因组组装是指在已有二代或三代或光学图谱辅助组装的Draft genome序列和已知染色体数目的前提下,利用Hi-C测序数据将Draftgenome序列进
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单细胞基因调控网路思路发7+
大家好,今天跟大家分享的是发表在Molecular Therapy: Nucleic Acids (IF: 7.032)上的一篇关于单细胞基因调控网络的一篇文章。该文章将乳腺癌bulk水平下的分子亚型
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pacbio数据比对工具-blasr介绍
三代测序如今越来越普及了,小编就介绍一下用来比对三代数据的工具blasr。类似于blast,但与他不同,因为blasr侧重于长序列整体比对了,并且容忍一定的错误率,而blast更测重于局部较严格的比对
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面向精准医学的微生物组学及其应用高峰论坛 第二轮通知
面向精准医学的微生物组学及其应用高峰论坛第二轮通知2015年1月20日,美国总统奥巴马在国情咨文演讲中启动精准医疗计划。同年2月,习总书记批示科技部和国家卫生计生委,要求国家成立中国精准医疗战略专家组
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miRNA 综述文章阅读笔记
最近由于看基因组文章看的有点兴奋,于是返了个场,学习下micRNA。下载了一篇自己捯饬的paper,啃了很久还是不是很明白,然后我突然看了一个单词,vivo,原来只以为vivo就是手机只能照亮你的美,