行业观点

16S rRNA OTU标准聚类阈值(97%)过时了? 16S rRNA普遍应用于环境微生物多样性分析,OTU是微生物多样性分析中的一个基本概念,在得到质控后的数据后,我们要做的第一件事情就是进行OTU的聚类。目前OTU的聚类方法与软件有很多种,这些方法都会用97%的相似性对序列进行种水平的聚类,然而97%的阈值是在1994年基于当时少量的16S rRNA序列提出的,是否适用于当前大量的16S r