行业观点
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单细胞+空间转录组,分析炎症性肠炎的标志细胞与组织
溃疡性结肠炎和克罗恩病具有令人困惑的异质性。近日自然通讯的论文,通过单细胞转录组结合空间分子影像,揭示了患者之间最大的差异存在于包括巨噬细胞和嗜中性粒细胞在内的骨髓间隔内,通过将单细胞 RNA 测序鉴
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Ancient human faeces reveal gut microbes of the past
Ancient human faeces reveal gut microbes of the past远古人类的粪便揭示了过去的肠道微生物人们越来越认识到肠道微生物是如何塑造健康和疾病的。现在,一项
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bulk转录组结合单细胞转录组数据构建肝癌预后模型
大家好呀!今天给大家介绍一篇2021年11月刚刚发表在frontiers in Cell and Developmental Biology(IF:6.684)上的文章。本研究结合转录组和单细胞转录组
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10X,Chicago和HI-C组装谁会赢?
一、10X在2015年备受瞩目的测序黑马当属10X Genomics无疑,通过将来自相同DNA片段(10-100kb)的reads加上相同的barcode,然后在illumina平台上进行测序,最后通
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转录组甲基化联合分析思路鉴赏
整合分析胶质瘤中DNA甲基化和基因表达来识别关键表观基因Integrative analysis of DNA methylation and gene expression to identify
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免疫浸润新玩法-细胞对思路重磅来袭
今天跟大家分享的是发表在Frontiers in Immunology(IF: 7.5607)上的一篇文章,主要是基于细胞对算法构建新型免疫浸润细胞特征,并且识别出新的癌症预后标志物,思路清晰,流程简
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基于深度学习的甲基化时钟
随着对衰老研究的深入,已发现表观遗传时钟是一种工具,可以帮助研究人员更好地理解和衡量衰老过程。基于几个甲基化位点,就可以预测实际年龄。近日npj aging发表的论文“A pan-tissue DNA
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如何利用NCBI预测基因的结构域和保守位点
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。出现如下