行业观点

基因组组装评估    越来越多的动植物、细菌真菌的基因组被公布出来,目前对于De novo组装的基因在准确性方面的评估手段相对比较少,评估效果有的时候也并不是很理想。常用评估方法:1、组装指标Contig和Scaffold指标(这个在错连较少的情况下,越高越好);2、二代数据或三代校正后的数据与基因组比对,通过Mapping率和覆盖度评估序列一致性,回比率越高组装效果越好;3、通过EST或转录组数