行业观点

大家好呀!今天跟大家分享的是2021年5月发表在Computers in Biology and Medicine (IF:4.589)上的一篇文章,主要是根据深度学习和XGboost使用15种癌症的多组学数据构建预后模型。作者的研究表明基于多组学数据的模型准确的较高,其中mRNA数据的贡献程度最高。使用乳腺癌的三个GEO独立数据集验证DCAP-XGB的性能,结果表明该模型可以准确区分高风险组和低

  • 转录组预后模型看腻了?那么试试多组学signature吧!

    转录组预后模型看腻了?那么试试多组学signature吧!

    行业观点 2025-02-12 14:07:08

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  • 交流群WeGAP-欢迎加入

    交流群WeGAP-欢迎加入

    行业观点 2025-02-12 13:53:08

    做公众号已经三年多了,每日一推,大家来阅读,这种单向互动,实际上可能起的效果有限,更多的是传递我们的信息。但相信大家看我们的推送时,有好多想对小编说的话都没有机会说,当然也限于小编的能力,也不能够与大

  • HGT:水平基因转移简单介绍

    HGT:水平基因转移简单介绍

    行业观点 2025-02-12 13:40:08

    简单介绍基因水平转移是不同物种之间或细胞器间基因的交流。基因水平转移现象在原核生物中普遍存在, 在真核生物中近年来也发现了众多例证, 说明水平转移是生物界的普遍现象。在已有的基因水平转移研究中进化树分

  • 一网打尽实验证实炎症ncRNA

    一网打尽实验证实炎症ncRNA

    行业观点 2025-02-12 13:26:08

    NcRI是一个人工挖掘炎症性疾病中实验证实的非编码RNA数据库,2020年六月发表在BMC Genomics。数据库目前包含三个物种:人类、小鼠和大鼠;三个主要的非编码RNA类别:miRNA、lncR

  • 科技杂谈:讨论也可以躺桌上

    科技杂谈:讨论也可以躺桌上

    行业观点 2025-02-12 13:12:08

    不久前,人类首次探测到引力波,验证了爱因斯坦一百年前所做的预测。人们在惊叹爱因斯坦天才之时,不禁感慨,面对茫茫宇宙苍穹,为什么他会有如此伟大的好奇心。笔者由此想到一个曾和爱因斯坦发生论战,并在量子理论

  • TCGA数据下载

    TCGA数据下载

    行业观点 2025-02-12 12:59:08

    最近听说还有人不知道怎么下载TCGA数据,“有时候找找自己原因好吧,这么多年了数据下载方式还不知道,有没有认真查资料”。小编汇总整理了三种常用的下载方式,三种方式从难到易,没有代码基础的同学可以直接跳

  • 【收藏】常用的基因组数据库汇总

    【收藏】常用的基因组数据库汇总

    行业观点 2025-02-12 12:45:08

    小编列举了一些常用的基因组综合数据库网站,供大家参考使用。同时我们招募一批详细介绍下面网站用法的小编,欢迎留言。留言格式:单位+数据库。数据库为您想介绍的。一、综合基因组数据库1. NCBI的Asse

  • 跪了,乳头状甲状腺可变剪切又发了5+

    跪了,乳头状甲状腺可变剪切又发了5+

    行业观点 2025-02-12 12:31:08

    对不起,生信人粉丝,小编给你们道歉,小编太保守了。从17年开始第一篇cancer letter上文章发表的解读2017-12-19癌症相关可变剪切的深度分析~~到生信人录制的可变剪切课程上线2018-

  • MEGA教程(四)

    MEGA教程(四)

    行业观点 2025-02-12 12:18:08

    3、系统发育树的构建Mega程序构建系统发育树的功能很强大。它提供了四种构建系统发育树,还包括一些检验程序。这四种构建分子系统树的方法为:Neighbor-Joining(NJ,邻接法)、Minimu

  • 听说,缺氧+免疫研究火了

    听说,缺氧+免疫研究火了

    行业观点 2025-02-12 12:05:08

    单一的基因集预后思路大家都很熟悉了,eg: 自噬、免疫等,简单且常见,宛如肥宅单身狗的单调乏味生活;两个以上基因集强强联合的预后分析你见过吗?是否能爆发更强大的作用呢,这是毋庸置疑的。毕竟走在大街上偶