行业观点

考虑这样一个问题,“如果要保证基因组上95%的区域其覆盖深度在30x以上的话,那么最低的平均测序深度应该是多少?”。  关于测序量的估计,对于做生物信息的人来讲应算是家常便饭了,多数时候我们都能直接根据以往项目的经验来获得,或是说的更具体些,在变异检测中一般要有25x以上的覆盖度才能得到一个比较靠谱的结果,于是以此为目的给出测序量的估计值;当然少数情况下也会有直接拍脑袋拍出一个值来的疯狂行为,不过