行业观点

去年给大家介绍了一个数据库ncRI,收集了大量炎症中的非编码RNA。数据库的简介和使用这里就不赘述了。今天为什么提到这个呢?因为到目前为止,好像还没有人基于这个数据库的数据进行挖掘和发文。通过阅读今天这篇文章,小编发现这个数据库能派上大用场。具体如何有效利用,且让我们先看看今天这篇研究炎症反应相关基因的文章。文章三月份发表在Frontiers in Oncology(IF: 4.848)。 An

  • 小数据库派上大用场

    小数据库派上大用场

    行业观点 2025-03-25 09:56:08

    去年给大家介绍了一个数据库ncRI,收集了大量炎症中的非编码RNA。数据库的简介和使用这里就不赘述了。今天为什么提到这个呢?因为到目前为止,好像还没有人基于这个数据库的数据进行挖掘和发文。通过阅读今天

  • Circos中的三种数据格式文件介绍

    Circos中的三种数据格式文件介绍

    行业观点 2025-03-25 09:43:08

        Circos整体学习(2) Circos中的三种数据格式文件介绍Circos主要是展示关系的,因此小编简单的介绍下circos中关于关系部分是如何展示的,其实这些关系首先你已经利用各种手段获取

  • circos简单了解

    circos简单了解

    行业观点 2025-03-25 09:30:08

     Circos整体学习(一) circos简单了解Circos软件是常用的展示图片的软件,其主要是perl中svg画图的集成包。主要是调用svg进行图片的绘制。前段时间小遍也简单介绍了在线绘制circ

  • DiseaseMeth2:人类疾病甲基化数据库介绍

    DiseaseMeth2:人类疾病甲基化数据库介绍

    行业观点 2025-03-25 09:17:08

    今天小编给大家安利一个发表在《Nucleic Acids Research》上的人类疾病甲基化数据库哈,该数据库已经更新到第二个版本啦,对于大多数发完文章就停止维护的数据库来说,这是非常有态度的一个数

  • 单细胞测序知多少

    单细胞测序知多少

    行业观点 2025-03-24 15:47:08

    单细胞RNA测序(single-cell RNA-seq,简称scRNA-seq)单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象,提取 mRNA 进行逆转录、放大和高通量测序分析,能揭示该细胞内 整体水平的

  • TCGA数据分析利器又更新啦—GEPIA 2021!

    TCGA数据分析利器又更新啦—GEPIA 2021!

    行业观点 2025-03-24 15:34:08

    今天小编要和大家分享的是GEPIA 2021,大家可能都知道GEPIA是利用TCGA数据做可视化分析中比较著名的一款在线工具,该网站由北大张泽民教授团队开发,2017年发表在Nucleic Acids

  • CDS和ORF的区别

    CDS和ORF的区别

    行业观点 2025-03-24 15:20:08

    ORF和CDS的区别ORF的英文展开是open reading frame(开放阅读框)。CDS的英文展开是coding sequences (编码区)。CDS:DNA转录成mRNA,mRNA经剪接等

  • 群体遗传学的一些概念

    群体遗传学的一些概念

    行业观点 2025-03-24 15:07:08

    1.分子钟:分子水平的恒速变异,或分子进化速率在不同种系中恒定。2.中性理论:(1)进化过程中的核苷酸置换绝大部分是中性或者接近中性的突变随机固定的结果,而不是正向达尔文选择的结果。(2)许多蛋白质多

  • 文献查找使用工具

    文献查找使用工具

    行业观点 2025-03-24 14:54:08

    介绍两个获取文献的好工具第一个是刘晓乐团队开发的文献挖掘系统,输入关键词,会列出相关的文献,可以设定SCI影响因子优选文献。搜出的文献相关性非常高。工具链接:http://gnosis.cistrom

  • 如何评估应该测多少数据量

    如何评估应该测多少数据量

    行业观点 2025-03-24 14:40:08

    考虑这样一个问题,“如果要保证基因组上95%的区域其覆盖深度在30x以上的话,那么最低的平均测序深度应该是多少?”。  关于测序量的估计,对于做生物信息的人来讲应算是家常便饭了,多数时候我们都能直接根