行业观点

很多人问怎么计算病人的生存时间,怎么获取病人的治疗方案,怎么知道病人肿瘤转移位置等等,每个人研究关注点不同,但是TCGA提供了非常详细的病理资料以供不同的研究人员研究,今天就用胃癌作为例子简单讲解一下。如果使用TCGA简易下载工具的同学,可以直接下载胃癌的临床资料,然后合并成矩阵就能得到每个病人的临床病理资料的矩阵文件,如果是使用其他工具下载的可能需要自己整理一下,总之TCGA对每一种类型的数据命

  • TCGA临床病理随访资料解读

    TCGA临床病理随访资料解读

    行业观点 2025-03-25 11:05:08

    很多人问怎么计算病人的生存时间,怎么获取病人的治疗方案,怎么知道病人肿瘤转移位置等等,每个人研究关注点不同,但是TCGA提供了非常详细的病理资料以供不同的研究人员研究,今天就用胃癌作为例子简单讲解一下

  • 不同平台的数据能否合并

    不同平台的数据能否合并

    行业观点 2025-03-25 10:51:08

    在生信分析过程中,尤其是转录组分析中,经常会遇到测得数据不足,需要利用公共数据库中已有的数据,那么能将这些数据直接和测序的数据混合吗?如果贸然混合,会有什么问题?10年nature有一篇综述,专门讲这

  • 最新单基因思路汇总,给你的实验添砖加瓦

    最新单基因思路汇总,给你的实验添砖加瓦

    行业观点 2025-03-25 10:37:08

    科研道路千万条,单基因研究为第一条。单基因的研究首先要做的也是最重要的就是挑选研究基因,毕竟一个有研究意义的基因直接关乎了做实验结果的好坏以及是否能被审稿人认可。怎么从生信的角度去挑选基因和设计研究思

  • 科研意义的故事

    科研意义的故事

    行业观点 2025-03-25 10:10:08

    科研是创造故事,就是向别人去讲自己的故事。成功的科研就是创造动听的故事,科研的大成果就是影响社会进步的大故事。诚然,听故事的学习和讲故事的科研永远是交叉在一起的,我们的生活不主要就是听故事和讲故事么?

  • 小数据库派上大用场

    小数据库派上大用场

    行业观点 2025-03-25 09:56:08

    去年给大家介绍了一个数据库ncRI,收集了大量炎症中的非编码RNA。数据库的简介和使用这里就不赘述了。今天为什么提到这个呢?因为到目前为止,好像还没有人基于这个数据库的数据进行挖掘和发文。通过阅读今天

  • Circos中的三种数据格式文件介绍

    Circos中的三种数据格式文件介绍

    行业观点 2025-03-25 09:43:08

        Circos整体学习(2) Circos中的三种数据格式文件介绍Circos主要是展示关系的,因此小编简单的介绍下circos中关于关系部分是如何展示的,其实这些关系首先你已经利用各种手段获取

  • circos简单了解

    circos简单了解

    行业观点 2025-03-25 09:30:08

     Circos整体学习(一) circos简单了解Circos软件是常用的展示图片的软件,其主要是perl中svg画图的集成包。主要是调用svg进行图片的绘制。前段时间小遍也简单介绍了在线绘制circ

  • DiseaseMeth2:人类疾病甲基化数据库介绍

    DiseaseMeth2:人类疾病甲基化数据库介绍

    行业观点 2025-03-25 09:17:08

    今天小编给大家安利一个发表在《Nucleic Acids Research》上的人类疾病甲基化数据库哈,该数据库已经更新到第二个版本啦,对于大多数发完文章就停止维护的数据库来说,这是非常有态度的一个数

  • 单细胞测序知多少

    单细胞测序知多少

    行业观点 2025-03-24 15:47:08

    单细胞RNA测序(single-cell RNA-seq,简称scRNA-seq)单细胞转录组分析以单个细胞为特定研究对象,提取 mRNA 进行逆转录、放大和高通量测序分析,能揭示该细胞内 整体水平的

  • TCGA数据分析利器又更新啦—GEPIA 2021!

    TCGA数据分析利器又更新啦—GEPIA 2021!

    行业观点 2025-03-24 15:34:08

    今天小编要和大家分享的是GEPIA 2021,大家可能都知道GEPIA是利用TCGA数据做可视化分析中比较著名的一款在线工具,该网站由北大张泽民教授团队开发,2017年发表在Nucleic Acids