之前推送过这个思路，ceRNA发到7绝对不简单！！其实这边文章做的就是跨癌型构建耐药的ceRNA网络。更进一步，从这一点出发，可以构建耐药的其他模型，可以构建其他的ceRNA网络，思路很容易举一反三，思考和行文容易自洽推进。有兴趣想深入探讨本方案的可以加v详聊以下为正文竞争性内源性RNA （ceRNA）参与了各种生物学过程，是一种重要的调控机制，在癌症的治疗中起着重要作用。ceRNA的构建不难，毕竟已经有非常多的靶点预测方法和在线工具。但也因为ceRNA的构建不难，反而增加了ceRNA发文的难度，毕竟都会构建，很难保证你做的比别人要好。看完今天这篇文章，相信你不会构建完ceRNA，只简单刻画临床特征。构建完ceRNA，加上抗癌药物的刻画，为文章加分。文章二月份发表在Molecular Therapy-Nucleic Acids（IF: 7.032）。

跨15种抗癌药物与耐药性相关ceRNA的全面刻画一、摘要：癌症仍然是世界范围内的主要健康问题。癌症的治疗失败很大程度上归因于耐药性。竞争性内源性RNA（ceRNA）参与各种生物学过程，因此会影响癌症的药物敏感性。但是，尚未进行药物敏感性相关的ceRNA的全面表征。这篇研究，作者构建了15种ceRNA，涵盖15种抗癌药物。并且基于抗癌药物ceRNA识别了一个与患者生存与癌症分期密切相关的交叉网络（ICN）。二、材料方法：miRanda，RNAhybrid，TargetScan，PITA，TarBase，miRTarBase，CellMiner，Argonaute-cross-linking和CLIP，LncRNADisease，COSMIC，miR2Disease，HMDD，TRANSFAC三、结果：1.15种抗癌药物ceRNA全面landscape与比较

.15种抗癌药物ceRNA网络

.15个ceRNA网络相似性与hub节点

.15个ceRNA网络相KEGG富集分析

.15个抗癌药物ceRNA网络边分布

.15个抗癌药物ceRNA网络度分布

.lncRNA不同类别的分布

.ceRNA染色体分布2.15种药物ceRNA与癌症hallmark关联

.15个抗癌药物ceRNA网络与癌症hallmark关联3.15种药物ceRNA网络ICN构建与治疗潜力

.不同药物交叉ceRNA网络

0.ICN实验验证

1.H19和HIF1A是miR-17-5p的直接靶点

2.ICN中药物敏感性与基于相关性4.CAG与ICN中基因互作

3.ICN中基因与CAG表达相关性5.ICN临床关联

4.21种癌症ICN的临床关联

总结：

这篇文章是以药物的角度出发，而不是肿瘤的角度出发。因此，如果你想研究某个癌症的ceRNA，这篇文章的思路会为你的研究增色不少。最后，除了前段时间为大家介绍的一篇单基因角度刻画ceRNA的文章，最近小编又发现一篇肝癌中单基因角度出发刻画ceRNA的文章。并且两篇文章都在7+水平，要是能结合今天这个思路，相信水平还能有所提升。有生信相关问题联系：18501230653欢迎关注转录组| 甲基化 | 重测序 | 单细胞 | m6A|多组学  cytoscape | limma | WGCNA |水熊虫传奇|linux电泳 | PCR | 测序简史 | 核型 | NIPT | 基础实验 基因| 2019-nCoV | 富集分析 | 联合分析 |微环境 瘟疫追凶| 思路汇总| 学者 | 科研 | 撤稿| 读博|工作