行业观点
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bulk转录组结合单细胞转录组数据构建肝癌预后模型
大家好呀！今天给大家介绍一篇2021年11月刚刚发表在frontiers in Cell and Developmental Biology（IF：6.684）上的文章。本研究结合转录组和单细胞转录组
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10X,Chicago和HI-C组装谁会赢？
一、10X在2015年备受瞩目的测序黑马当属10X Genomics无疑，通过将来自相同DNA片段（10-100kb）的reads加上相同的barcode，然后在illumina平台上进行测序，最后通
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转录组甲基化联合分析思路鉴赏
整合分析胶质瘤中DNA甲基化和基因表达来识别关键表观基因Integrative analysis of DNA methylation and gene expression to identify
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免疫浸润新玩法-细胞对思路重磅来袭
今天跟大家分享的是发表在Frontiers in Immunology（IF: 7.5607）上的一篇文章，主要是基于细胞对算法构建新型免疫浸润细胞特征，并且识别出新的癌症预后标志物，思路清晰，流程简
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基于深度学习的甲基化时钟
随着对衰老研究的深入，已发现表观遗传时钟是一种工具，可以帮助研究人员更好地理解和衡量衰老过程。基于几个甲基化位点，就可以预测实际年龄。近日npj aging发表的论文“A pan-tissue DNA
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如何利用NCBI预测基因的结构域和保守位点
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。出现如下
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冉冉升起的单细胞新聚类方法
Hello又跟大家见面了，这次给大家带来的文献解读是关于使用一致性聚类方法从单细胞RNA-seq数据识别癌症亚型（Identification of cancer subtypes from sing
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甲基化450k芯片数据的处理和分析软件汇总
上一期我们已经介绍了肿瘤相关的甲基化高通量数据，我们得出的结论是当前甲基化芯片数据的存储量占有绝对优势。既然如此，我们本期介绍甲基化450k芯片数据的分析软件和方法。（当然最新的850k芯片也类似）总