行业观点
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Science 重磅:泛基因组比对工具Griaffe,短序列检测结构变异
全基因组分析,数十年以来,都是先将测序数据,比对到一个线性的参考序列上,之后进行变异检测。但当样品和参考基因组存在较大差异,或种群多样性较高时,受限于线性的参考基因组带来的比对偏向性,会影响变异检测
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国自然热点-非编码RNA第二弹
今天跟大家分享的是发表在journal of cellular physiology(IF: 5.546)上的一篇文章,主要是通过机器学习方法构建核仁小分子RNA(snoRNA)的表达特征,对头颈部癌
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《自然》:中国的荟萃分析文章太多了!
国际著名meta分析研究学者,斯坦福大学教授John Ioannidis在最近一篇论文中表示,科学文献分析的黄金标准真正遭受玷污。他的意思是说,荟萃分析和系统性评论本来是循证医学的重要工具,但现在被许
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Hi-C组装荣登Science-传播寨卡病毒蚊虫基因组
刚接触基因组组装时候对于read,contig,scaffold是啥玩意,感觉好迷糊啊,为啥们搞个组装还要打断测那么短的read呢,直接把整条染色体测了不就行了,不用组装,还省事。但后来慢慢接
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百用不厌的基质-免疫分析又来啦
今天跟大家分享的是发表在Frontiers in Oncology(IF: 4.8483)上的一篇文章,主要是基于TCGA和CGGA中胶质瘤数据集,利用单样本基因集合富集分析(ssGSEA)算法根据胶
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blast软件的使用
1、把BLAST的压缩文件解压,然后将bin目录下的文件拷贝至/usr/local/bin下;2、制作软链接,将解压后的文件中bin目录链接至/home/username下,eg:ln -s /hom