lncRNA这两年可谓研究的热火朝天,各种基金申请,各种lncRNA最新研究铺天盖地袭来,这里我们就来说说lncRNA究竟都做了哪些研究? 1、差异表达筛选
通过lncRNA芯片或RNA-seq测序等方法对多对疾病模型和对照样本组织进行lncRNA表达谱分析。2、生物信息分析

通过生物信息学的方法筛选出具有表达差异的lncRNA,构建共表达网络,预测lncRNA的靶基因。3、细胞分子水平研究
(1)功能获得性研究:构建lncRNA过表达载体(2)功能缺失性研究:可通过siRNA、shRNA、反义核酸等方法沉默lncRNA,干预lncRNA后检测其对疾病相关基因表达的影响和对细胞表型如增值、凋亡、侵袭、转移等的影响(3)可通过RNA pull down、RNA-RIP、ChIRP-seq等方法检测与lncRNA结合的DNA、RNA、蛋白质。4、动物实验
(1)构建移植瘤或原位瘤模型,转移模型(2)导入siRNA或者lncRNA表达质粒(3)检测肿瘤生长曲线(4)通过免疫组化、RT-PCR、Western Blot等方法检测相关指标变化。小知识RNA-RIP技术(RNA Binding Protein Immunoprecipitation)是一种高通量检测细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP技术下游结合microarray技术被称为RIP-Chip,帮助我们更高通量地了解癌症以及其它疾病整体水平的RNA变化。CHIRP-Seq( Chromatin Isolation by RNA Purification )是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白的高通量测序方法。方法是通过设计生物素或链霉亲和素探针,把目标RNA拉下来以后,与其共同作用的DNA染色体片段就会附在到磁珠上,最后把染色体片段做高通量测序,这样会得到该RNA能够结合到在基因组的哪些区域;如果结合物是蛋白质,可以通过将蛋白质打断成短肽再通过质谱进行鉴定,从而或者与RNA结合的蛋白质。RNA Pull down技术与此类似。生物芯片
Arraystar LncRNA Microarray芯片覆盖当前各个lncRNA数据库,用于检测已知lncRNA在不同样本之间的表达差异,或检测疾病样本中表达异常的lncRNA。高通量测序平台
高通量测序不仅能够检测已知lncRNA表达量,还能发现全新的lncRNA。
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