让生信分析助力国自然!!!

admin 60 2024-12-23 编辑

让生信分析助力国自然!!!

近日,2022年度国家自然科学基金项目指南发布,代表2022年国自然申请正式起航!同学们,一年一度的国自然科学基金又双叒叕要开始申请了,而生物信息个性化挖掘也成为助力国自然中标不可或缺的一部分。毕竟借助生物信息可以有效的加速课题,提高国自然中标率。但时间或许并没有想象的那么多了,所以小编在这里根据目前研究的最新进展整理如下的科研热点,并且利用几个具体案例为大家展示生信分析与国自然热点如何融合。旨在为大家在构思国自然的过程中,提供新的灵感,为你的国自然标书锦上添花~

☆本文看点

一、国自然最新热点

二、生信分析融入国自然案例

三、小编聊一聊

☆具体内容

一、国自然最新热点

外泌体

外泌体是胞内多泡体与细胞膜融合后,释放到细胞外的膜性小囊泡,是细胞间信号传输的载体。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。2013年,诺贝尔生理学或医学奖授予了三位科学家,表彰其在细胞间囊泡运输调控机制领域作出突出贡献,将外泌体研究的热度推向高潮。近几年由于在临床上的巨大应用价值,其研究热度持续攀升,成为科研热点,相关论文发表数量呈爆炸式增长。

线粒体

线粒体是存在于所有真核细胞中的独特的膜结合细胞器,作为ATP生产和细胞能量供应的主要场所,线粒体的特征(线粒体拥有自身的遗传物质和遗传体系,但其基因组大小有限,是一种半自主细胞器。除了为细胞供能外,线粒体还参与诸如细胞分化、细胞信息传递和细胞凋亡等过程,并拥有调控细胞生长和细胞周期的能力,其自身的蛋白质合成机制以及严格调节的膜电位梯度)使其成为重要的研究课题,另外,随着衰老过程和更多其他人类疾病方面的研究发现,线粒体的作用比以往更加值得我们研究。

非编码RNA

非编码RNA(noncoding RNAs, ncRNA)是指不编码蛋白质的RNA。其中包括rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA 、microRNA 和lncRNA等多种已知功能的 RNA,还包括未知功能的RNA。按照长度可分为两大类:大于200 nt(核苷酸)的称为长非编码RNA(lncRNA),小于200 nt的称为小非编码RNA(small ncRNA),50 nt以下的还可称为tiny ncRNA,如siRNA、miRNA和piRNA等。近几年来,虽然非编码RNA的研究热度有所下滑。但是在国自然项目中,ncRNA依旧是国自然数一数二的热点之一。如果你对2022年的国自然申请还没有方向,那么这个热点需要你慎重考虑一下。

肿瘤免疫

肿瘤免疫治疗是指应用免疫学原理和方法,通过激活体内的免疫细胞和增强机体抗肿瘤免疫应答,特异性地清除肿瘤微小残留病灶、抑制肿瘤生长,打破免疫耐受的治疗方法。肿瘤免疫治疗就是要克服肿瘤免疫逃逸的机制,从而重新唤醒免疫细胞来清除癌细胞。由于其副作用小、治疗效果明显,正逐渐成为未来肿瘤治疗的发展方向,被称为继手术、放疗和化疗之后的第四大肿瘤治疗技术。目前,已应用在临床上的肿瘤免疫治疗方法主要包括免疫检查点抑制剂治疗、过继性细胞免疫治疗、癌症疫苗及一些新兴免疫治疗方法等。

肠道菌群

肠道菌群:生存在人的肠道里的大量细菌构成的集体,就叫做肠道菌群。肠道菌群并不是人与生俱来的。胎儿在子宫里是处于无菌状态的,但胎儿出生后,伴随第一口呼吸、第一口乳液、第一嘴辅食,肠道菌群的始祖们,也随着食物、空气、水进入肠道并安营扎寨,不断壮大队伍,扩充地盘,最终形成稳定的菌群构成。“肠道菌群”近年来“CNS”级别文章频发,同时也是国家自然科学基金资助的重点方向之一,其适用的研究领域也迅速扩展,从经典的中医、中药领域,到代谢性疾病、神经系统疾病、心脑血管疾病和免疫相关疾病,再到近年新的热点—“肠道菌群与肿瘤”,发展势头强劲。

m6A

近年来,科学家们发现了一种可逆的RNA甲基化—m6A,即RNA分子腺嘌呤第6位氮原子上发生甲基化修饰(N6-methyladenosine,m6A)。研究发现,m6A是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰之一,m6A在细胞加速mRNA代谢和翻译,以及在细胞分化、胚胎发育和压力应答等过程中起重要作用。各种研究迹象表明m6A 存在于很多物种中,占到了 RNA甲基化修饰的80%。m6A除了分布在 mRNA 中,也出现在很多非编码 RNA中 ,如:环状RNA 、LncRNA等。现如今,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,国自然资助的项目数量也逐年上升。

细胞死亡(铁死亡为例)

细胞死亡是一种生命现象,是细胞不可逆的一种生命过程,代表细胞生命的结束。正常的组织中经常发生细胞死亡,它是维持组织机能和形态所必须的。细胞死亡包括细胞主动死亡-程序性死亡、细胞凋亡和细胞被动死亡即细胞坏死。而铁死亡(Ferroptosis )是一种铁依赖性的,区别于细胞凋亡、细胞坏死、细胞自噬的新型的细胞程序性死亡方式。铁死亡的主要机制是,在二价铁或酯氧合酶的作用下,催化细胞膜上高表达的不饱和脂肪酸,发生脂质过氧化,从而诱导细胞死亡;此外,还表现为抗氧化体系(谷胱甘肽系统)的调控核心酶GPX4的降低。

单细胞测序

单细胞测序(Single-cell sequencing)是指获取单个细胞遗传信息的测序技术,即对单个细胞水平上,对基因组或转录组进行提取扩增和高通量测序分析。该技术能够揭示单个细胞独有的基因结构和基因表达状态,包括结构变异、拷贝数变异、RNA表达水平等数据,使不同细胞类型得以精确区分,并有助于科学家在但细胞水平进行分子机制的研究。

二、生信分析融入国自然

生信分析作为交叉学科,综合利用生物学,计算机科学和信息技术揭示生物学奥秘。因为生信分析处理的是大量而复杂的生物学数据,所以利用生信分析最有可能产生重大的科学突破,使科学发生革命性的变化。具体的来说,在生信分析强大的背景下,可以将数据整合后,找出有价值的分子(基因、蛋白), 再去做验证实验,大大降低了发表文章的难度。用生信分析提高自身研究的广度和深度,可以使自己的国自然标书提升一个档次。所以在这里我结合两个具体的案例讲述生信如何融入国自然。

外泌体RNA生物标志物设计思路肠道菌群课题设计思路

三、小编聊一聊

事实上,申请基金就跟投SCI 一样,不能光做得好,还得写得好。一个有意义、够创新、还有科研基础的研究,也可能会因为平淡无奇的标书而与国自然失之交臂。我写本篇文章旨在为正在申请国自然的科研人员介绍国自然热点,并尽可能让申请者将生信融入课题撰写中,提高标书的档次,最终有助于广大科研人员少走弯路,更好的进行国自然基金项目申报的准备工作。对了,关于热点内容,公众号有更多高质量解析,欢迎大家关注、点赞~

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