加油血小板!

admin 79 2024-12-20 编辑

“新三年旧三年,缝缝补补又三年”,血小板可真是忙了一年又一年。作为“抗洪”主力军出身的血小板,遇到癌症之后技能表可谓是年年刷新年年新。

今天小编给大家分享2篇血小板相关的文章,内容和影响因子真的平易又近人。

第一篇

一组血小板相关循环长链非编码RNA作为结直肠癌的潜在生物标志物

IF=5.736

摘要

有证据表明,受肿瘤诱导的血小板(TEPs)有可能成为癌症诊断的生物标志物库,但分离的难度限制了它的应用。由于大多数循环RNA来自于血小板,血小板中RNA谱系的改变可能导致血清中RNA表达的改变。在本研究中,作者确定了一个血小板相关的长非编码RNAs(lncRNAs)小组,并评估了其在结直肠癌(CRC)患者血清中的诊断能力,为CRC诊断的血液检测清单增加了新的lncRNA生物标志物,并为CRC血小板和血清之间的通信提供了分子证据。

背景

CRC是第三大常见恶性肿瘤,尽管由于不同的生活方式和饮食特征,CRC的发病率在全球范围内有所不同,但新诊断的CRC的上升趋势在不同地区表现出相似性。先前的研究发现,通过粪便免疫化学试验(FITs)、结肠镜筛查、愈创木酚基粪便潜血试验(gFOBT)和乙状结肠镜检查(柔性乙状结肠镜检查)筛查的患者的结直肠癌死亡率显著降低。然而,由于价格高、耗时长或感染和肠穿孔风险高,这些筛查方法的广泛应用受到限制。最近的研究致力于开发新的可用于常规患者监测的血液诊断生物标记物。最近的证据表明,lncRNA生物标记物可以更好地动态检测癌症状态,尤其是在血液中。

在本研究中,作者旨在评估大肠癌患者血清中TEP衍生的lncRNAs的表达,并构建具有显著lncRNAs的诊断模型,以研究其在区分大肠癌患者中的准确性。此外,我们评估了这些循环lncRNAs与病理特征之间的相关性,以探索诊断性lncRNAs的潜在病因机制。

研究设计如所示,本研究包括三个独立的数据集:发现集、训练集和个体验证集。

 

结果

肿瘤培养血小板中调控异常的lncRNAs的鉴定

CRC患者和健康对照血小板中的lncRNA表达谱。A. PCA分析图显示了沿PC1和PC2的所有54个样本。B.对ANOVA定义的128个差异表达基因进行分层聚类。C和D.火山图(C)和MA图(D)说明了lncRNA配置文件中数据的分布

研究人群的特征

诊断循环lncRNAs的建模和评估

训练集中CRC患者和健康对照血清样本中4种lncRNA的表达水平和诊断价值。A.与健康对照相比,CRC患者血清中的LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1上调。B.通过 ROC 分析计算训练集中诊断组的AUC和用于诊断CRC的各个lncRNA组件的AUC。C.训练集中构建的循环lncRNAs判别模型的参数

基于4种lncRNAs模型的验证

基于4-lncRNAs的模型在验证集中CRC患者和健康对照的血清样本中的诊断性能。A.与健康对照相比,CRC患者血清中的LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1上调。 B通过ROC分析计算诊断组的AUC和验证集中用于诊断CRC的单个lncRNA组件的AUC

lncRNAs与临床病理特征的相关性

讨论

血清中的RNA表达水平在很大程度上取决于TEPs。该研究发现,4种lncRNAs(LNCAROD、SNHG20、LINC00534和TSPOAP-AS1)在大肠癌患者的TEP和血清中均存在失调,具有一致的变异特征。这一观察结果表明了这4个lncRNAs在大肠癌发生中的病因学价值,并为阐明TEPs与癌细胞通过血液相互作用提供了新的分子证据。

(这篇文章发了5分,不信也得信!)

第二篇

PDGFRA作为年轻结直肠癌患者治疗靶点的作用

IF=5.531

摘要

由于早期诊断和治疗的困难,年轻的结直肠癌(CRC)患者与老年患者相比表现出较差的预后。然而,其潜在的分子特征仍不清楚。作者利用全外显子组和RNA测序对49名无遗传性CRC患者的肿瘤和匹配的正常样本进行了全面分析。作者的研究表明,年轻患者的CRC与CMS4(Consensus molecular subtype 4)和血小板衍生生长因子受体α(PDGFRA)有关。此外,PDGFRA可能服务于新型治疗策略的潜力,并代表年轻CRC患者对瑞戈非尼反应的预测性生物标志物。

背景

在结直肠癌患者中,除遗传性癌症综合征外,一些早发结直肠癌是由遗传性基因突变引起的。基因组和转录组水平的比较分析将为年轻大肠癌的分子机制提供更多细节和见解。最近,提出了一种更详细的基于基因表达的大肠癌分类,包括以下四种生物学上不同的一致分子亚型(CMS)[19]:CMS1(微卫星不稳定性(MSI)和免疫激活)、CMS2(上皮型和标记的WNT信号)、CMS3(上皮型和代谢失调),和CMS4(间充质型和活化TGF-β信号)。CMS4的临床相关性与不良预后相关,而其他的预后相对较好,对单个CMS组的分类对于推进CRC患者的精确医学具有巨大潜力。

在这项研究中,作者对49例大肠癌患者进行了综合分析,通过肿瘤和匹配的正常样本的全外显子组和RNA测序来了解年轻患者的分子特征。为了识别年轻大肠癌患者的特异性生物标志物,作者将样本分为三组:年轻组(<40岁)、中年组(41-60岁)和老年组(>60岁)。这三组的比较可以区分年轻和老年大肠癌,并揭示更清晰的分子亚型和基因组改变。该研究提供了对年轻大肠癌和新生物标志物的深入了解。

结果

根据结直肠癌患者年龄的CMS分类

 

年轻和老年大肠癌的mRNA差异表达和基因谱分析

年轻结直肠癌和老结直肠癌组织之间的差异mRNA表达和基因分析。a 差异表达基因的火山图。b年轻和老年组之间差异表达基因的维恩图。c所选基因表达谱的热图。d来自表达中显着改变的基因的丰富途径。e CRC相关突变(错义、无义和剪接)的Oncoprint。f样本中经常检测到的拷贝数扩增和缺失

年轻CRC患者中高水平的PDGFRA表达

PDGFRA在年轻和老年CRC患者中的表达。a PDGFRA mRNA表达和年龄的散点图。b年轻CRC组和老年CRC组中PDGFRA表达水平之间的箱线图。c CMS4患者中PDGFRA表达水平的比较。d按年龄组划分的三个类别的 CMS 类型饼图(上图),以及年轻 CRC 组和老年CRC组中PDGFRA表达水平之间的箱线图(下图)

PDGFRA与CMS4相关因子的共表达

EMT和血管生成因子的共表达。a PDGFRA和EMT相关特征之间的基因表达水平散点图。b PDGFRA和血管生成相关特征之间的基因表达水平散点图。每个点代表一个根据CMS类型着色的样本。密度图显示年轻组和老年组的表达水平比较

患者来源的细胞(PDC)中PDGFRA的表达和PDGFRA靶向药物反应

PDC中PDGFRA表达和PDGFRA靶向药物反应。a年轻和年老PDC中 PDGFRA表达水平(RT-qPCR)之间的箱线图。b年轻和年老PDC中PDGFRA的蛋白质印迹。c通过敲低年轻患者PDC中PDGFRA的活力。d通过敲除老年患者PDC中PDGFRA的活力。e PDC对regorafenib的敏感性。所有用于PDC的患者术前均未接受任何治疗

讨论

从转录组学数据中,作者发现与CMS4相关的PDGFRA在年轻大肠癌患者中明显高于老年大肠癌患者。当PDGFRA被siRNA下调时,年轻患者PDC的增殖率明显低于老年PDC。年轻的CRC特异性通路包括PDGFRA信号传导、通过VEGF激活的PDGF受体信号传导对细胞增殖的正向调节、细胞趋化性、趋化性调节、PLC活性的正向调节和磷脂酰肌醇磷酸化。这些结果表明PDGFRA可能是年轻大肠癌患者的一个生物标志物,并且可能在CMS4相关通路中发挥关键作用。年轻大肠癌患者的CMS分类可以更好地告知临床医生新治疗策略的预后和潜力。该研究数据显示,雷戈拉非尼对PDGFRA上调的年轻大肠癌的PDC更敏感,可能是治疗年轻大肠癌患者的潜在候选药物。

无论多少,只要有益于医药卫生事业的发展,那就“人间值得”~

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