剧透!失巢凋亡已经有生信文章被接受了!

admin 5 2025-02-11 11:18:44 编辑

小编昨天刚预测接下来会有失巢凋亡的生信文章出来,本来计划过几天再去搜索一下相关文章,但是直觉告诉我“你现在找找吧,你调研一下说不定就有新文章出现”。结果,不找不知道,一找吓一跳(还是小编直觉准啊,希望下次买彩票的时候能灵光乍现)

有篇预后模型的生信文章已被Frontiers in Genetics(IF:4.772)接受,(小编上次说了预后模型是比较快且好发的文章)激动的心,颤抖的手,小编我站起来跟您讲。

虽然还没有正式发表,但是这东西你能等吗,这可是“一个萝卜一个坑”,它是有时效性的(啊不然拿什么讲“创新点“)小编必须立马分享给大家,不然就真的晚了。

背景

HNSCC是世界上第六大最常见的癌症,也是头颈部最常见的恶性肿瘤。

失巢凋亡是一种程序性细胞死亡的形式,它对肿瘤细胞从细胞外基质中获得分离后的存活至关重要。在侵袭性肿瘤细胞中产生的失巢凋亡抗性已被确定为肿瘤进展的关键因素,但是很少有研究关注在头颈鳞癌失巢凋亡与转移之间的关系。

于是作者探讨了失巢凋亡相关基因在头颈鳞癌中的预后价值,并进一步探讨失巢凋亡相关风险评分组间患者肿瘤微环境的差异。

结果

与预后相关的失巢凋亡相关基因(ANRG)的识别

ANRG获取:从GeneCard和Harmonizome共获得358个失巢凋亡相关基因。(注意是相关基因,不是失巢凋亡“嫡系”基因哦,不要问为什么,小编也不知道)

使用单基因cox获得33个与预后相关的基因,并对这33个基因进行刻画(),其中有24个与较差的预后显著相关。

利用33个ANRG对HNSCC分子亚群进行一致性聚类

该HNSCC队列可很好地被分为三个亚型,总体生存分析显示,3种亚型之间的预后有显著性差异。ANRGs表达热图及三个亚型的临床病理特征表明LTF基因可能是预后良好的因素,并对三个亚型间不同的功能富集途径进行探索()。

三种亚型中的基因表达和免疫浸润

用箱线图显示了三组亚群中ANRG的表达差异,由于与总生存率相关,这些差异基因可能是影响HNSCC患者预后的关键分子以及靶向治疗的潜在靶点(A)。此外,免疫细胞浸润水平也有显著性差异(B),亚型B中激活的CD4、CD8和B淋巴细胞的比例明显低于其他两种亚型的。

预后signature构建和验证

失巢凋亡相关预后signature展示出良好的预测效能()。

不同风险评分组的GSEA和免疫活性

探索在高、低风险得分组中的肿瘤微环境(TME)景观()。

建立HNSCC患者预后列线图

ANRG与TME的相关性分析

使用单细胞数据集分析TME中7个ANRGs的表达情况()。

药物敏感性分析

总之,基于失巢凋亡相关基因构建了一个预后模型能够很好地预测HNSCC患者的生存率,对与这一模型相关的分子机制的研究。

当小编看完这篇文章的时候,整体感觉就是,怨种啊/(ㄒoㄒ)/~~,明明比去年同水平的文章卷,分析过程掉的头发应该也不比同类型8分的文章少,这至少是个5的水平才对!(小编就是这么耿直,不接受烂菜叶子臭鸡蛋哈哈)

由于还没有正式发表,所以对于获取到的内容中一些细节,小编认为还是值得再完善的。但这并不妨碍我们继续做失巢凋亡相关的研究,因为一个科学问题可以有多种解读方式。

已经发表的文章方向,大家是都能看到的,小编把它们总结归纳之后预测失巢凋亡会是下一个热点或者说已经悄悄变成热点了,现在看来小编说的没错。趁它进入大众视线之前,已经有人在行动了,不要等太久。

剧透!失巢凋亡已经有生信文章被接受了!

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