前言

当开始准备着手去研究某个物种时，那么首先要对这个物种进行调研，主要是基因组大小、杂合和重复序列占比的情况，目前评估基因组大小的方法基于NGS的小文库数据，通过Kmer分析全面了解某一物种基因组特征（基因组大小=总Kmer数目/主峰深度），这个方法评估常规物种效果没得说，但如果是一个复杂物种（多倍体或杂合非常高的时候），再确定哪个为主峰时就会出现分歧（这个主峰深度直接影响基因组评估结果），所以就需要借助另外一种手段“流式细胞”来对基因组大小进行大致评估，然后在结合Kmer评估结果确定主峰深度得到更为准确的基因组调研信息，便于后续制定相对方案进行拼接。今天小编给大家介绍一个查询基因组大小的网站，它是收录比较全面的物种基因组大小信息的数据库网站。

动物

首先查询动物基因组可以打开以下网站：http://www.genomesize.com/index.php或者打开百度输入genomesize找到下图这个可以

点开首页是这个网站的介绍，它目前共收录了6,222个物种大小信息，800多篇相关文章，这里查询到的是C-value值，其单位为pg，换算成通常基因组的公式1pg=978 Mb。

下面说一说具体一些操作和小编的一些经验。

点开Search Data跳转到下一个界面（如下图），这个数据库的开发人员已经对收录的信息进行分类，可以按照他的分类进行查找，但是呢小编觉得这个信息量有点大，有时候还是比较费事，这里小编介绍自己使用的一些经验，它有一个搜索模式，就是下图红圈圈处。

那么搜索的关键字怎么选取呢，通常可以输入需要查询物种的拉丁名（三个框框里都去试一下），但如果没有搜索到任何信息的时候，接下来可以尝试利用其英文名去检索，通常情况应该能搜索到，如果没有那很大可能就是这里边也没收录相关信息。这里小编以梭子蟹举个栗子，其拉丁名为Portunus trituberculatus，英文Crab。

首先以“Portunus”为关键字搜索可以搜到一个结果。

如果“Crab”搜索，这个结果会比较全面，选择我们所关注的物种信息就可以。

红圈圈就是物种大小的结果，按照上面公式进行换算就OK了，后面还有一些方法和相关文章等，这些小编也没有太细研究过，如果有小伙伴了解可以留言，大家互相学习，一起进步。

植物

动物查询网站介绍了那必不可少的植物来一波，小编觉得真菌可以直接在NCBI上查询，植物的话可以在这个在下面的这个网站http://data.kew.org/cvalues/，打开界面如下

这个数据库收录了1,400多个物种信息，按照被子、裸子、蕨类、苔藓和藻类植物进行分组，但这个数据库貌似是2012年底之后没有在进行版本升级。

这个可以按照它设定的分类进行查询，也可以直接点开最前边的那个进行查询，这里边需要先给他邮箱，下面就是一些结果输出内容，这个就根据个人需要进行勾选，它的这个搜索模式与动物的差不多。

这里以小麦为例进行查询，可以看下这个结果信息很详细，染色体数目、倍性等都有详细说明，植物相对于动物来说倍性是比较值得关注的一个点，通常Kmer图出现的怪怪的也是植物较为多，比如小麦就有二倍体、四倍体和六倍体，里边有涉及到同源或者异源多倍体等等等，太复杂了。。。

编后语

以上就是小编在做基因组调研图时的一些心得，如果有说的不妥或遗漏之处欢迎大家后台留言，小编一定虚心接受。