数据分析

高通量测序常常会在文库准备和测序环节出现影响后续序列比对、基因表达量估算等过程的质量问题，如低测序质量碱基、特异序列干扰、3′/5′端错误、PCR非特异扩增和测序接头污染等。其中一些问题可以通过序列质控、去接头、误差校正等策略去避免；但也有另外一部分潜在的问题，无法通过现有手段去解决，需要对结果进行详细讨论。目前已有许多Read质量评估和预处理的软件。Read质量评估软件包括FastQC、PRIN