RNA

CIBERSORT作为经典的bulk RNA反卷积工具,自15年由Alizadeh实验室Newman等人开发出来发表在NBT上,就被广泛使用,截至目前为止,引用次数高达1779。为了方便大家更好的使用这个工具,并解读其中的结果,今天跟大家一起学习一下该工具的基本实现原理和使用方法。反卷积模型设m表示bulk RNA基因表达谱(GEP),B表示marker基因的GEP,f表示bulk RNA中各细胞