RNA

有没有一种方法可以由本地化blast数据库里直接提取fasta格式的序列呢?答案就是blastdbcmd,一个blast+里的工具。最近,NCBI通过社交平台介绍了这一操作。 该操作十分简单,只需要几个参数。比如,你想提取NR蛋白质数据库中的下面这条序列。它的GI号是7717464,于是我们将GI号做为entry。 那么只需要输入:blastdbcmd -db nr -entry 7717464屏