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单细胞+空间转录组,分析炎症性肠炎的标志细胞与组织
溃疡性结肠炎和克罗恩病具有令人困惑的异质性。近日自然通讯的论文,通过单细胞转录组结合空间分子影像,揭示了患者之间最大的差异存在于包括巨噬细胞和嗜中性粒细胞在内的骨髓间隔内,通过将单细胞 RNA 测序鉴
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如何利用NCBI预测基因的结构域和保守位点
1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后点击Search。出现如下
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冉冉升起的单细胞新聚类方法
Hello又跟大家见面了,这次给大家带来的文献解读是关于使用一致性聚类方法从单细胞RNA-seq数据识别癌症亚型(Identification of cancer subtypes from sing
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甲基化450k芯片数据的处理和分析软件汇总
上一期我们已经介绍了肿瘤相关的甲基化高通量数据,我们得出的结论是当前甲基化芯片数据的存储量占有绝对优势。既然如此,我们本期介绍甲基化450k芯片数据的分析软件和方法。(当然最新的850k芯片也类似)总