背景介绍

这两天小编还沉浸在过节的快乐中，发现千呼万唤始出来的山羊基因组文章终于发表了，3月6号发在Nature Genetics上。

这距离山羊基因组公布其实过了很久了，不过我们还是回味下其神奇的组装水平。

这个牛叉的组装水平，其实也不用太稀奇，在三代+光学+Hi-C横行的时代，大家见怪不怪哈。小编在拜读这篇文章之后，发现其实这篇文章还在告诉我们如何守护自己的爱情，一共有四招。

第一招，学会显摆

这篇文章呢，没有在生物学故事上讲很多，主要是讲了这些牛叉的技术，这个可以作为一个基因组新技术普及的材料。文章详细的讲解了三代的好处、光学的好处、Hi-C的好处。以及这三个好基友在一起能够发挥多大的作用。

当然对于山羊基因组的发表，其团队还是比较低调的。文章中说，对于山羊基因组，我们主要是获取了一个目前最好的一个山羊基因组，并且是目前最为连续的哺乳动物类基因组（做嚣张状），这还不算完，继续叫嚣，这个基因组比之前的山羊基因组提升了400倍，还没完，我们对于1Kb左右的重复序列都搞定了，对于反刍类的长的重复序列家族、免疫基因都统统搞定。不过显摆，也是得有实力啊。

第二招，要任性

来给大家再次安利一张山羊的组装流程图。这个流程图在各个公司的散发的基因组海报和折页中都有。如何获取一个高质量的基因组啊？大家跟我一起读：

“三代+光学+Hi-C”

这个就跟楼下房地产中介说的房价会涨的一样，是真理，千万不要怀疑。话虽如此，这个组装策略可是花了老鼻子钱了，看来要任性，还是得有钱啊。

第三招，虐虐前任

最近女神节，不流行撒狗粮虐狗，流行虐前任。山羊基因组也不例外，看下图新基因组跟前任基因组（CHIR_1、CHIR_2）两位前女友的比较，赤裸裸的碾压。尤其是b图，对于原来版本中的gap进行了一一复原和比较。

这个图就是利用RH校正之后的基因组跟这个图谱比对的结果，更为连贯。

第四招，干掉第三者

婚姻中第三者插足最为头疼，在基因组中到处存在的重复序列，真正的影响基因的预测和注释，更为头疼。而山羊这篇基因组中干掉了大部分的重复序列，第三者。

如此酣畅淋漓的基因组文章，怎能不发高分文章。另外，这个文章教育我们如何获取守卫的爱情，大家有没有get到吗？

参考文献

Single-molecule sequencing and chromatin conformation capture enable de novo reference assembly of the domestic goat genome

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