一、说明

生存分析：对一个或多个非负随机变量进行统计推断，研究生存现象和响应时间数据及其统计规律的一门学科,既考虑结果又考虑生存时间的一种统计方法，并可充分利用截尾数据所提供的不完全信息，对生存时间的分布特征进行描述，对影响生存时间的主要因素进行分析。

生存分析不同于其它多因素分析的主要区别点：生存分析考虑了每个观测出现某一结局的时间长短。

本工具提供了便捷的批量计算基因表达的生存分析功能，简单实用，界面如图：

从图中可以看出，只需要四步：

step1：导入表达谱数据（第一列为基因，第二列开始为各样本的表达数据，第一行为样本名称）

step2：导入样本信息数据（第一列为样本，第二列开始为各样本的随访信息，其中包含死亡和生存时间）

step3：右侧选择死亡状态列和生存时间列，同时选择时间单位，还可以进一步筛选随访条件，比如默认（随访时间要大于1个月，生存时间截止日期十年，大于10年的默认为未死亡）

step4：批量运行即可得到每个基因的结果

然后结果展示页主要是对于一些基因的分类之后进行K-M曲线绘制，可以导出pdf和jpg两种格式的数据。

二、示例

以下我们使用GEO的一套数据来演示以下该工具使用

首先我们选择下载GSE25065数据集，下载之后使用GEO芯片数据转换器将数据提取出来，最终我们得到了这两个文件

打开SampleInfo.xls文件找到随访信息列：

去除其中的分号，保存

然后启动本工具，导入样本信息和表达谱数据，如图：

最终得到结果：

然后导出就OK了，结果中包括95%的置信区间，以及风险比，还有p值，使用方法是CoxRegression

我们导出结果：

结果包含两个文件，第一个是每个基因的Cox结果，第二个是样本的表达谱和对应的临床随访信息整合的表格，可以自己导入到R里面去分析

进一步的如果想观察每个基因的K-M曲线，该工具提供了K-M绘制曲线的功能，可以直观的看出分类效果，并提供导出pdf功能

与R语言相比如下：