在线编辑进化树工具

admin 28 2025-03-28 10:38:08 编辑

iTOL在线工具 tree of life

这个软件是一个在线的展示,编辑,注释和管理系统发生树的工具。 可以使你利用浏览器来实现对树的操作和处理。(小编英语有点差,大概其就是这个意思)

主要功能

TOL functions: introduction to basic functions

Tree annotation: annotating trees interactively and with external datasets

Tree management: working with workspaces and projects in your iTOL account

这里,我主要upload 一个树 展示先基本编辑的功能

基本编辑

首先点开上传一个树。记得给树起一个牛叉的名字,比对Animal_phy_evo(高达上)  支持三种上传格式:supported format (Newick, Nexus or PhyloXML)

(不了解的自行百度,或者等待我们后期更新)

支持两种形式的上传,直接粘贴,或者上传文件。

举例:(,dog);

上传后展示如下:

选中某个边,之后可以直接对这个边进行编辑:颜色,类型,字体类型,物种名字,树形结构等。

边加粗之后的效果展示:

另外肯定有人会问,可不可以批量的处理,比如对多个一起该颜色,一起加背景。

答案是肯定的:itol.embl.de/help.cgi 提供了详细的配置文件,这里我就不废话。大家有问题互相学习。另外还有其和其他数据库比对注释的情况,我也没有研究过,大家自己学习吧,总之这个东西很牛叉,想要好好的学习,还得亲自操作下。

官网部分作品展示

Binary dataset with multiple columns

3 simple bar chart datasets with a custom scale

Two pie chart datasets, one with internal and one with external pie charts

                               

10 value bar chart dataset with aligned fields

Example protein domain architecture dataset, exported from SMART.

另外还有一个很牛叉的在线工具:

EvolView, an online tool for visualizing, annotating and managing phylogenetic trees

网址:http://www.evolgenius.info/evolview/

希望大家有所收获。欢迎大家关注

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