今天周末,并且要出科了,稍微有些时间,就随便看了下文献,前段时间TCGA项目的收官之作“Pan-Cancer Atlas”泛癌症图谱在Cell 等一系列著名期刊上一口气发表了27篇大文章,吓得我等渣渣瑟瑟发抖。CellPress甚至特别为此制作了一个网站,专门介绍这些文章,这些文章大家自行去网站细细膜拜,给大家留个网址:http://www.cell.com/pb-assets/consortium/pancanceratlas/pancani3/index.html

每每看完这些文章,是不是你也有过那么一瞬间,热血沸腾,暗自想着,原来TCGA数据库能量这么大,不做实验都能发这么厉害的文章,我也要学R语言,学生信,自己分析TCGA数据库,做自己的研究,发自己的文章,让别人看去吧。
于是,在某个深夜,你独自在网上苦苦搜寻R语言的资料,逛遍各大论坛,技术博客,找到的资料铺天盖地,从中文到英文,从pdf到视频,你的百度网盘得以满载而归。然后,就没有然后了,从入门到放弃。
没错,小编有幸是大大最牵挂的人,白介素2最牵挂的人就是你们,这一次我要给你一个我觉得你无法拒绝的神器,满足你对别人的论文中炫酷图片的所有幻想,最重要的是它可以实现用几乎不需要编程,可使用傻瓜式点击来分析各种数据,表达谱数据,甲基化数据,临床分析等综合式挖掘,更重要的是它还免费。下面给大家看些图:
这不是你曾经想要的火山图吗?
那些迷人的柱状图,了解一下?
整合临床数据?
热图如此优秀?
Pathview?
当然,还有富集分析也少不了。
说出来怕你不信,如果你安装成功了,只需要2句固定代码,然后就可以愉快的点击,点击再点击,分析TCGA数据了,并且,这款神器同样支持自行导入自己的数据分析。
再给一个惊喜,就是这款神器的使用说明非常完备,连视频都录了,在有土鳖上免费观看,当然,如果你还问我怎么翻墙。。。。,那我可不告诉你了。
回复“TCGA神器”,就给你Paper,然后,愉快的学习吧,连视频都有了,再也不要从入门到放弃了。相信大家注意到了,为了降低生物学背景人员分析高通量数据的门槛,学术界也在不断努力,从各种各样的网页版网络工具,到点击式分析软件,你很容易发现,总体而言,我们分析数据的门槛在不断降低,将来只会更简单。因此,真正重要的还是研究的思想,方向,如何做到四两拨千斤。说实话,像类似于小编这样的生物医学背景的同学,我觉得具备应用软件分析数据的能力就已经够了,钻研算法,软件是生物信息学家们干的事,我们只想借助生物信息这样的工具,结合研究的问题,辅助研究。 这段时间小编在实习,目睹了专业型师兄师姐们在临床上忙得晕头转向,让他们再去学R语言,实在是太难为他们了,不过,这种神器,你们值得拥有哟。
今天就到这里吧,可能大家在学的过程中还会遇到困难,慢慢来吧,日拱一卒,就会有渐入佳境的感觉,每一次结尾,总要有句鸡汤,这次我要引用下我一位学长说的话:“不要只看到前方路途遥远而忘记自己坚持了多久”。 可能你也在为什么而坚持着,白介素2同学与你共勉。
2018年4月21日星期六
作者:白介素2
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