Venn图绘制的两种方式

admin 8 2025-02-03 编辑

1、R语言手动绘制

安装加载所需R包install.packages("VennDiagram")library(VennDiagram)

setwd("d:/venn")venn1<- venn.diagram(list(A = 1:150, B = 121:170),"venn1")    ##图片保存在指定文件夹中

同理可画出更多集合的韦恩图,通常情况下最多绘制五个集合的韦恩图venn2<- venn.diagram(list(A = 1:150, B = 121:170,C=75:234,D=23:190),filename=NULL)    grid.draw(venn2)   ##图片显示在屏幕上

美化:venn3<- venn.diagram(list(A = 1:150, B = 121:170,C=75:234,D=23:190),"venn3.png",  col = "black",fill = c("cornflowerblue", "green", "yellow", "darkorchid1"),alpha = 0.4,cat.col = c("darkblue", "darkgreen", "orange", "darkorchid4"), cat.cex = 1.5,rotation.degree = 0);参数:filename:指定用于保存图形文件的文件名,如果希望在当前的图形窗口中看到绘制的韦恩图,则filename必须为空;                 若希望将绘制的图形直接保存为某文件,则直接使用venn.diagram(...,filename='*')即可完成。col表示对应的圆周的颜色fill:表示各个集合对应的圆的填充颜色alpha:透明度cat.col:表示集合名称的显示颜色lwd:用于设定圆弧的宽度lty:用于设定圆弧的线型rotation.degree:可用于调整图形的旋转角度

2、利用在线工具绘制

摘要

基因组研究过程中,基因家族聚类分析是一个比较重要的内容。基因家族聚类过程中通常会用venn图来展示聚类的情况。

R语言或者其他的画图语言都可以本地实现venn图的绘制,但是有一个venn图的在线绘制工具,大家知道吗?

操作步骤

网址:http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/

下面我就简单的介绍下这个在线绘制venn图的工具,希望能在科研工作中助你一臂之力。

打开界面:

软件界面优化,目前只能绘制5个及以下的venn图,超过5个的不会绘制图片,但是也会进行分析。

提供两种数据输入方式,第一种是导入list文件,第二种是直接由键盘输入。我演示一下键盘输入:

点击提交 得到的结果如下

Venn图提供两种作图的方法,另一种格式如下:

你可以将图片保存下来。

Venn图绘制的两种方式

上一篇: 质粒构建工具推荐,实验室必备的分子克隆利器
下一篇: 怎么获取unique read?
相关文章