mRNAsi是一种描述肿瘤细胞与干细胞相似程度的指标，可以认为是CSCs的量化。干细胞具有自我更新以及治疗耐药性的特征，在癌症中发挥着重要作用。目前研究肿瘤干细胞大多通过RNA计算的mRNAsi进行相似程度评估。小编通过对19年和20年的文章进行研究，总体上说一共有两种相关的设计思路。种：mRNAsi评分高低分型代表文章：胱癌癌症干细胞（CSCs）的文章[Frontiers in Oncology；2019.7]1. 在BLCA中mRNAsi的分子亚型以及临床特征2. 筛选差异表达基因由于正常mRNAsi与肿瘤有显著差异，作者进一步进行了差异表达分析。从分析中筛选出8,510个DEGs，其中5,422个上调，3,088个下调。（B）3. WGCNA: 识别最显著的基因和模块4. 模块的功能富集分析5. 关键基因表达的分析与验证6. 因果关系以及蛋白质相互作用7. 关键基因和上游基因存在共表达第二种：mRNAsi相关的基因代表文章：Prognostic Value of a StemnessIndex-Associated Signature inPrimary Lower-Grade Glioma [Frontiers in genetics；2020.5]主要通过TCGA中已经公布的mRNAsi相关的基因直接跟差异基因取交集。然后包括差异分析、WGCNA、富集分析、风险模型、免疫评分，外部验证等。1、整体分析流程、WGCNA分析3、功能富集分析4、森林图预后分析5、KM曲线和模型验证扫码添加生信在线客服了解更多关于干细胞指数详尽方案