RNA提取,对于整个分子生物学实验来说,算是比较有难度的操作了,提取出RNA如何判断质量的好坏呢?那当然通过电泳图了。本次小编将讲述电泳图上的秘密,帮助您更好的来提取RNA,提高成功概率。
1. RNA条带不亮或缺失

(1)上样量不足。
(2)染色剂不足或染色剂分布不均匀。
(3)RNA跑出凝胶。电泳至溴酚蓝至凝胶的2/3即可停止电泳。另外电泳槽应水平放置,缓冲液要浸过凝胶,
(4)RNA在凝胶中发生扩散。避免长时间的电泳,否则小片段容易扩散。
(5)RNA降解。最大限度减少在紫外线下暴露的时间,使用新鲜的电泳缓冲液,新制的凝胶,电泳槽及制胶的模具梳子等用双氧水浸泡,高电压短时间电泳(20min)。也可能使用的组织材料不够新鲜(冷冻的材料必须在化冻之前将其磨碎)。
2. RNA条带弥散
(1)RNA被核酸酶降解。要用新的缓冲液,制胶用的模具要清洁,枪头要灭菌。
(2)电泳条件不适合。避免长时间电泳,缓冲液要浸过凝胶,电压要合适,不能过低。电压过高,造成电流过大,也容易引起此现象的发生。一般5—8V/cm.(聚丙烯酰胺电泳多采用8V/cm)所以计算采用电压时应先测量电泳槽两电极之间的距离。为了增加条带的清晰度,电泳开始的几分钟建议使用低电压。
(3)上样量过大。根据沉淀量的多少确定点样的量,一般1—3ul。
(4)胶孔不规则。插梳子时应垂直插入,凝固后拔出梳子。
3. 背景很高
(1)核酸染剂加入的量过多。应按说明书添加。
4. 点样孔发亮
(1)上样量过大。
(2)胶孔未凝固好,使样品无法往前移动。
(3)RNA样品中含有污染物,如残留的蛋白质容易引起此现象。可能trizol量太少,应加大trizol用量。另外若残留DNA也应考虑加大trizol用量。
5. 出现多条带
(1)RNA降解。提取过程中出现降解或电泳过程中出现降解(可能性较小)。
(2)上样量过大。RNA由多种类型组成,若上样量过大则会导致各种类型的RNA(tRNA,mRNA等)均会出现条带。
提取常见问题
1.研磨必须要充分,样品用量要严格。
2.处理的枪头离心管要量少多份,无RNAase的DEPC水也要量少多份,以备分装RNA和调浓度使用。
3.电泳时间10-20min,不宜过长,电压可为120-130V。
4.点样用的10ul枪头也要提前处理。
5.枪头离心管90℃烘干5——6h。
6.电泳时,可以点样Marker作阳性对照。
7.从-70℃冰箱中取出材料要在解冻之前迅速研磨。
8.提出的RNA可在70%酒精-70℃保存一年。
9.所有的东西必须有多余,防止出现用品的损失。
10.试剂瓶可以连续使用。
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