今天小编给大家安利一个发表在《Nucleic Acids Research》上的人类疾病甲基化数据库哈，该数据库已经更新到第二个版本啦，对于大多数发完文章就停止维护的数据库来说，这是非常有态度的一个数据库哦。

一、首页如下

有木有新版TCGA的赶脚。。。。

速度上网址：http://www.bio-bigdata.com/diseasemeth/

二、简介一下

DNA甲基化是高等动物基因组调控中的一个重要的表观遗传修饰，在疾病的爆发和发展方面有着重要的作用。通过甲基化特异性PCR和基因组谱水平的性能分析技术来采集和整理DNA甲基化数据能够极大的帮助发现潜在疾病的生物标记。然而，没有一个综合的人类疾病的DNA甲基化数据库，要完成这样的工作是很困难的。因此，我们建立了DiseaseMeth —一个人类疾病甲基化数据库。该数据库着重于有效收集和统计分析来自各种疾病的DNA甲基化数据。收集了32701个甲基化谱，涉及到88中疾病，甲基化相关的疾病基因关系对有679602个，当然为了促进数据的提取，DiseaseMeth支持包括基因ID和基因名称在内的多种搜索方式。DiseaseMeth提供了基于疾病和正常样品的横向整合的甲基化数据集。这些数据可以被用来深入识别差异的甲基化基因，并调查研究基因与疾病之间的关系。

DiseaseMeth包括了一个人性化和结构化的基因组浏览器，可以提供多基因组和表观遗传资料的同时直观浏览。该基因组甲基化浏览器连接到MySQL，一个用来显示病变甲基化信息概况以及其他基因组注释和表观遗传信息的后端。

DiseaseMeth 还提供了一些用来研究基因与疾病之间关系的工具，使得原本疾病与DNA甲基化之间难以分析的关系变的有效可行。这些浏览器主要是：疾病-基因关系分析工具、疾病-疾病关系分析工具、基因-基因关系分析工具。这3个工具具有可定制的分析给定数据的有点。

DiseaseMeth 还提供了三个新的在线工具用于聚类分析、功能注释及生存分析。

往脸上贴一下金，该数据库是由俺们哈医大张岩教授所领导的计算表观遗传学课题组开发并维护，目前已为来自世界91个国家七千余位科研工作者提供疾病甲基化信息服务。

三、文章如下

1. Xiong, Y., Wei, Y., Gu, Y., Zhang, S., Lyu, J., Zhang, B., Chen, C., Zhu, J., Wang, Y., Liu, H. Zhang Y. (2016) DiseaseMeth version 2.0: a major expansion and update of the human disease methylation database. Nucleic Acids Research.

2. Lv, J., Liu, H., Su, J., Wu, X., Liu, H., Li, B., Xiao, X., Wang, F., Wu, Q. and Zhang, Y. (2012) DiseaseMeth: a human disease methylation database. Nucleic Acids Res, 40, D1030-1035.

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