小编平时工作不涉及下载数据,突然需要下载人的转录组数据,有点捉急。在同学们的帮助下我顺利的下载下了数据。
这里简单的介绍下下载数据的两种方法。

1。本地浏览器或者迅雷或者wget
打开NCBI
选择SRA
搜索结果如下,随便选择一个点击
找到这句最重要的话
这里wget后面的可以通过修改改为你要下载的东西,然后下载。
比如你要下载 SRR2442055,你要下载的路径就是在sra/SRR/SRR244/SRR24420555/SRR24420555.sra(规律很明显,自己找)
这样,就可以把这个链接直接打开用浏览器下载,或者bia 到迅雷下载。
2。另外有牛人会选择AsperaConnect 下载
这个软件关于linux版的应用,我略懂一些。首先去官网下载linux版本的connect client
然后拷贝到linux相应的目录下,解压安装,安装命令为:sh aspera-connect-3.6.0.106805-linux-64.sh(版本号可能不一样)
安装好以后,会在HOME目录下新建一个叫.aspera的目录,有两个文件比较重要
一个是ascp的可执行文件:
~/.aspera/connect/bin/ascp
另一个ascp的密钥文件:
~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh
下载时需要这两个文件。
提供一个下载的例子:ascp -i asperaweb_id_dsa.openssh -QT -l300m anonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR234/SRR2345230/SRR2345230.sra /destPath/
操作很简单,就不多说啦!