夏天快到了，大家也不要怠于科研哦。今天给大家聊一聊新型lncRNA LINC02532在胃癌中的作用[Novel long non-coding RNA LINC02532 promotes gastric cancer cell proliferation, migration, and invasion in vitro]。长链非编码RNA（lncRNA）是一种长度超过200个核苷酸的单链RNA，它没有蛋白质编码功能。已有研究表明，lncRNA在胃癌的发生发展过程中起着重要的作用。鉴于lncRNA的关键功能，有必要在胃癌中识别和探索新型的lncRNA。

首先是生物信息学预测和数据处理，从TCGA数据库下载375例胃癌和32例正常组织的RNA-Seq数据和患者的临床信息数据。Firebrowse网站提供来自TCGA数据库的综合数据，因此从该网站中获取了胃癌的成熟miRNA测序数据。RNA22工具用于预测靶向miRNA。

其次是研究方法，第1步，通过TCGA胃癌 RNA-Seq数据的处理，识别出上调的LINC02532。采用qRT-PCR法检测胃癌细胞系和组织的表达水平。第2步，进行CCK-8和菌落形成试验，伤口愈合试验，Transwell细胞迁移侵袭试验来评估细胞增殖，迁移和侵袭。第3步，通过Firehose和RNA22软件程序的数据分别识别和预测在胃癌中下调并由LINC02532海绵吸附的miRNA。第4步，从TargetScan，miRDB和DIANA在线工具获得miRNA下游靶基因，随后进行基因功能和KEGG通路富集分析。对于统计分析，基于t检验或卡方检验进行统计学比较，Kaplan-Meier方法和对数秩检验用于生存分析。

LINC02532在胃癌中表达上调并且与预后不良相关

在分析TCGA数据库的胃癌 RNA-Seq数据后，发现LINC02532在肿瘤组织中的表达明显高于正常组织(图A)。随后分析了LINC02532表达与胃癌患者总体生存的关联，Kaplan-Meier生存曲线显示，LINC02532的高表达组跟低表达组相比，其预后较差(图B)。52例胃癌患者和细胞系的qRT-PCR结果也表明，LINC02532在胃癌中上调(图C和D)。

为了探讨LINC02532的表达水平是否与胃癌的发生发展有关，分析了其表达与临床病理特征的关系，结果表明，LINC02532的高表达与TNM分期高、分化程度差有关。

LINC02532促进胃癌细胞增殖

为了研究LINC02532在体外的作用，将3种针对LINC02532的siRNA转染到SGC-7901和SGC-803细胞系中。qRT-PCR结果显示，siRNA #1和#2对LINC02532的表达下调更为明显(图A)。因此，选择siRNA #1和#2进行进一步的功能检测。CCK-8试验表明，LINC02532基因敲除能有效抑制胃癌细胞增殖(图B)。此外，菌落形成实验表明，LINC02532敲除后，细胞增殖率下降(图C)。所有这些发现都表明，LINC02532可以促进胃癌细胞增殖。

LINC02532促进胃癌细胞迁移和侵袭

作者进一步进行Transwell细胞迁移侵袭和伤口愈合试验来研究LINC02532对胃癌细胞迁移和侵袭的影响。结果显示，LINC02532敲除降低了SGC-7901和SGC-803细胞的迁移和侵袭能力，表明LINC02532促进了细胞迁移和胃癌的侵袭。

生物信息学分析识别LINC02532 海绵吸附的miR-129-5p和miR-490-5p

为了进一步探索分子机制，假设LINC02532可能通过海绵吸附的miRNA促进胃癌细胞增殖，迁移和侵袭。首先，使用在线软件iLocLncRNA预测了LINC02532的亚细胞位置。结果表明，细胞质是LINC02532亚细胞定位，这极大地支持了LINC02532可能作为ceRNA发挥作用的理论。此外，发现有两个miRNA（miR-129-5p和miR-490-5p）都是LINC02532的潜在靶点并且在胃癌中被下调（图A）。通过TargetScan、miRDB和DIANA软件获得了218个潜在的miRNA靶基因(图B)。

 靶基因的功能和KEGG通路富集分析

确定这些靶基因的功能可揭示LINC02532在胃癌中的新分子作用，因此对218个靶基因进行功能富集分析。生物学过程分析表明，这些基因在细胞周期停止阶段富集，以应答损伤、肿瘤坏死因子和细胞活力的调控。在分子功能方面，这些基因主要参与蛋白结合、转录因子结合和激酶活性。KEGG通路分析显示，这些基因在癌症、细胞周期和p53信号通路的转录失调中显著富集。

总的来说，LINC02532作为胃癌的致癌基因，有望成为胃癌治疗和预后的靶点。

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