服务内容1:生信分析鉴定关键基因位点
![计算生物学分析服务,上新](https://www.yanyin.tech/cms/manage/file/3cbf4872347a4fdd93ec5dc0c218f42c)
通过全面精细化生物信息学手分析方法,获取DNA序列差异化信息。并通过深层次数据挖掘分析,探寻特殊基因位点信息。
案例:XYZ蛋白质突变位点信息为:1205T>A、1341G>T,其对应突变氨基酸序列为:R125N、E154I。
服务内容2:蛋白通路与疾病关联性分析
利用现有数据库,找寻与2基因突变位点信息对应的蛋白通路。氨基酸突变往往引起蛋白质结构发生较大变化,导致蛋白通路上下游作用变化,进而引起疾病产生。
如:XYZ蛋白质在Gα3-XYZ-CRF通路蛋白中占据重要位置,该蛋白质突变将引起通路受阻,下游蛋白作用丧失,进而引起乳腺组织表达异常,最终导致乳腺癌疾病的发生。
服务内容3:同源建模
同源建模Homology modeling是利用已知的蛋白质三级结构为参照,分析氨基酸序列相近的新蛋白的三级结构的技术。给定氨基酸序列,通过Modeller等建模软件获取蛋白质建模三维结构,并通过分子动力学分析获取初步的可靠蛋白结构。
服务内容4:分子对接&分子动力学模拟
分子对接molecular docking是依据配体与受体作用的“锁-钥原理”,模拟分子配体与受体生物大分子手提相互作用的方法。分子对接主要分为“蛋白质-小分子”、“蛋白质-蛋白质”、“蛋白质-核酸”对接。
蛋白-小分子对接
分子动力学模拟是研究微观世界的有效手段,可以较为直观的模拟分子在真实状态下的运动状况,模拟器真实运动机理,成为了计算生物学未来的主要发展方向。
服务内容5:机理分析
通过分子对接、分子动力学等方法,模拟不同分子间相互作用机理,阐述生物结构变化所导致的变化状况,阐明人体生物致病等生物性状机理。
实例展示:正常蛋白:体内激素小分子Hormone可与口袋中形成完美几何匹配,并与氨基酸R125、E154之间形成稳定的氢键H-bonds作用。突变蛋白:N125、I154氨基酸侧链为小化学片段,氢键作用完全丧失,导致Hormone分子与蛋白质作用不稳定,因而无法激活XYZ蛋白,使其无法正常行使生理作用,最终导致Gα3-XYZ-CRF通路失灵,引发疾病。
服务内容6:计算机辅助药物筛选&&药物设计
致力于提供出色的计算机辅助药物设计支持和服务,缩短新药研发时间,为各类药物靶标提供设计解决方案。
在蛋白质三维结构基础上,彻底分析了蛋白结合口袋周围理化性质:小分子结合口袋周围亲疏水作用性质、氢键铆钉作用、稳定性、结构多异性、盐桥作用、共价键作用、Pi-Pi等相互作用模式。
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