高通量测序与数据挖掘实操研讨班

2017年9月16日～17日（15日下午报到） 上海 

【课程简介】

生物信息学广泛应用于生命科学的各个领域，已经成为21世纪生命科学与生物技术的重要突破口。随着高通量测序技术的快速发展，以基因组学为代表的研究工作获得了国家、省部级重点资金的重点资助。但是，面对海量的基因信息数据，如何借助多种生物数据挖掘工具对这些数据进行有效的分析和深入的研究，成为生命科学工作者们关注的焦点。因此，为方便各位老师更好的将生物信息学分析应用于测序数据，更好的在通过生信分析发现科研问题，上海玮瑜生物科技有限公司特地推出了这一期的高通量测序与数据挖掘实操研讨班，为广大科研工作者提供高通量测序数据挖掘、生信分析等方面的学习。

【主办单位】上海玮瑜生物科技有限公司

【主讲老师】宋伟  上海交大博士，专注生物信息学进十年。参与并主导尔云100多个专著和2项专利的撰写申请。精通perl、R等编程语言，有丰富的项目分析思路设计和个性化分析经验，擅长转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析及疾病预后与关联分析等。

【课程内容】

时间

课程

9.16

基因芯片（microarray）和二代测序（NGS）的数据介绍

根据SCI文献，实例讲解生物信息学在高通量测序中的应用

NCBI、GEO数据库使用介绍，芯片公共数据库的查找、下载。

测序标准化分析报告解读和标准化的差异分析处理

上机实操：各大数据库的使用

TCGA数据（样本量最大最权威的癌症研究数据库）  KEGG 数据库（信号通路、代谢通路、疾病通路等等）、mirBase数据库  其他常用数据库、公共数据的查找、下载、差异分析处理方法

NCBI数据库（包括GEO、pubmed、GENE等）    

9.17

GO功能富集分析、KEGG pathway

蛋白与蛋白互作分析（string）教学

Cytoscape软件作图

拓补学分析、聚类模块分析

上机实操：

差异表达基因GO和pathway

蛋白互作网络（PPI）关系对的分析

cytoscape网络图和模块分析

 【时间地点】

2017年9月16日～17日（15日下午报到）  上海莫泰酒店会场

【注册费用】2400元/人 注册费包含教材、午餐等费用。【付款方式】

1，转账或支付宝：    2，现场刷卡或现金：（可以刷公务卡）

【缴费账号】

A：汇款账户

账户名称：上海服淡信息科技有限公司    账户号：31578103002581719

开 户 行：上海银行桃浦支行

B：支付宝转账

收款人：wybiot@163.com    支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司

【酒店入住】

上海莫泰酒店 单间（含早餐）260元/人  上海虹口区广灵二路5号

【说明】

1、请自带笔记本电脑,会场我们会布置足够电源插座。

2、现场使用的学习软件和练习素材参会当天统一发放并指导安装。

【联系方式】谢老师 13611825136 E-mail：wybiot@126.com

报名方式