常去的网站

admin 2 2025-02-05 编辑

NCBI

美国国家生物技术信息中心 ( National Center for Biotechnology Information ,NCBI ) 是美国国家分子生物学信息资源中心,也是全球最有影响的生物学网站之一。 NCBI 开发有 Genbank 等公共数据库,提供 Pubmed 、 BLAST 、 Entres 、 OMIM 、 Taxonomy 、 Structure 等工具,可对国际分子数据库和生物医学文献进行检索和分析,并开发用于分析基因组数据和传播生物医学信息的软件工具。 NCBI 还支持与推广多种医学及科技方面的数据库,包括:三维蛋白质结构的分子模型数据库 ( MMDB) 、孟德尔人类遗传( OMIM )、特殊人类基因序列集( UniGene )、人类基因组基因图( Gene Map of the Human Genome )、生物分类游览器( Taxonomy Browser )以及与国立癌症研究所合作的癌症基因组解剖学项目(CGAP )等。 NCBI 的所有数据库和程序软件都可在 NCBI 的匿名 FTP 服务器( ftp : //ncbi.nlm.nih.org )上获取。

EMBL

欧洲分子生物学实验室( EuropeanMolecular Biology Laboratory , EMBL ) ,1974 年由几乎全部西欧国家及以色列等 16国资助在德国海德堡建立的国际研究学院网络,致力于分子生物学研究,在德国、法国、意大利、英国设有 5 个分支机构。1980 年,建立了世界上第一个核酸序列数据库,即 EMBL 核酸序列数据库。

EBI

欧洲生物信息学研究所( EuropeanBioinformatics Institute , EBI )是EMBL 的一部分, 1992 年由欧盟资助建立在英国的一个非盈利性学术机构,也是生物信息学研究与服务的欧洲中心。该研究所开发有多种生物学数据库,包括:核酸序列数据库(EMBL 核酸序列数据库、 Ensembl 、 EMEST 、MitBase Server 、 EDGP 、 Parasites 等),蛋白质序列数据库(SWISS-PROT 、 TrEMBL 、 InterPro 等),全部基因组数据库,序列结构分类数据库(DSSP 、 HSSP 、 DALI 等),大分子结构数据库(EBI-MSD 等),人类蛋白质组数据库( HPI 等),序列图谱数据库(RHdb Server GenomeMaps98 等);也提供CLUSTAL 、 FASTA 、 SRS 、WU-BLAST 等工具,为各国研究人员提供来自学术界的分子生物学、医学与农业、遗传学、化学、生物技术、药学工业等多方面的资源信息。

ExPASy

蛋白质分析专家系统(Expert Protein Analysis System , ExPASy ),是 1994 年由瑞士生物信息学院(Swiss Institute of Bioinformatics , SIB ),创建的世界上第一个分子生物学网站,专门从事蛋白质序列、结构、功能和蛋白质 2D-PAGE 图谱的分析。在瑞士、澳大利亚、玻利维亚、加拿大、中国、韩国、美国等国家和地区设立有镜像站点。通过该网站可链接到国际上包括 ENZYME 、 PROSITE 、 TrEMBL 、 SWISS-PROT 、 SWISS-2DPAGE 、 SWISS-3DIMAGE 等数据库的有关核酸、蛋白质、基因组序列,结构与功能的 1000 多个相关站点,以及SWISS-MODEL 等软件工具

RCSB

结构生物信息学研究联合实验室( the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics , RCSB ),是一个非盈利性研究机构,主要通过对生物大分子三维结构的研究来探索生物系统的功能。 RCSB 提供有 PDB 生物大分子结构数据库( PDB , http : //www.rcsb.org/pdb/ )和 NDB 核酸数据库( NDB , http : //ndbserver.rutgers.edu/ )等数据库,并提供其开发的结构分析工具、标准和教学服务信息等。

NIG

日本国立遗传学研究所 日本国立遗传学研究所( National Institute of Genetics , NIG ),是日本遗传学各方面研究的中心研究机构及生命科学所有领域的研究基地,其建立的日本 DNA 数据库( DNA DataBank of Japan , DDBJ ),与欧洲 EBI 维护的 EMBL 数据库和美国 NCBI 的 GenBank 数据库并列为国际上最著名的三大 DNA 数据库。通过该数据库的检索界面可以链接 PDB 、 DDBJ 、 PIR 、 ENZYME 、 SWISSPROT 、 PROSITE 等多个数据库。

另外其他的go,kegg,wego,DAVID等,我就不废话啦。

论坛和博客类型

生物谷 http://www.bioon.com

丁香园:http://www.dxy.cn/bbs/

中国生物论坛: www.biooo.com

小木虫:http://emuch.net/bbs/

PLOS:www.plos.org

生物信息学天空:http://www.bioxxx.cn/forum.php

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当然了这些只是小编平时用到的网站,大家从事不同的方向肯定有不同的偏好。

有人可能要问了,这么多记不住怎么办?

记不住就拿本本赶紧记录下来啊。

不想抄怎么办?

懒!!!

当然了世界是由懒人推动的,大家记不住上面的没关系,记住一个网址就行啦。http://gps.shengxin.ren

这个是一个生信常用网站的导航,从基因组到转录组,从DAVID到veen图绘制,可谓是杂七杂八,啥都有啊,最重要的是可以自定义哦。一般人我不告诉他。

赶紧使用吧!

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