如何成为顶级的生物信息学家？

答：看你的研究。

我们将生物信息学研究（注意，不是生物信息学者本人）的水平划分成五个层次。

0级 (Level 0)：为建模、而建模（modeling for modeling’s sake）。简称：渣级。

之前有人问：“现在数据这么多，能建模的东西一大把，那我们该干点啥呢？““你想解决啥问题？““建模的问题。“

这就像我坐电梯看见认识的研究生，说小伙最近忙啥呢？答：做水稻呢。继续问：具体研究的啥？不高兴了，诧异：研究水稻啊！然后给我解释了半天中国要研究水稻的必要性。这个回答是OK的，如果科学家仅仅将自己当成数学家、统计学家、计算机科学家、物理学家，或者像我这样用嘴巴研究水稻的吃货，因为在这些学者各自的领域里，确实有许多好的理论建模问题。但如果这些学者是认真对待生物信息学的研究，这个回答不OK。许多0级生物信息学家们从来不读或者不发表生物学期刊上的论文，也不参加生物学的会议，因此这个级别属于“未入门级”。

1级（Level 1）：给数据、能分析。简称：菜鸟级。

这类研究一般是分析自己或者合作者实验室里未发表的数据，并试图获得新的生物学发现。相比与0级，这已经有很大的进步，并且是训练生物信息学者最好的途径之一。可以练习将已有的生物信息学技术来做出真正生物学发现的技巧，学习更多的生信技术和生物学知识，可以启发、衍生出2级和3级的好课题。1级虽然是“入门级”，但非常非常重要，所有生信专业研究生的必经之路，非生信领域的学者或学生，能达到1级中已可算是高手，进阶到1级上那就是凤毛麟角了。

2级（Level 2）：想新招、玩数据。简称：肉鸟级。

具有2级水准的生信研究有：1) 设计方法解决生物医学相关大数据分析中普适、定量的问题。比如咱生信课本里经典的用于双序列比对的Smith-Waterman算法等等；2) 设计算法来分析新的高通量技术所获得的数据，例如华大基因设计的用于二代测序短读段 (read) 映射到基因组上的SOAP系列工具，这就是典型的2级工作；3) 从各种公共数据中通过整合建立数据库或数据资源。这个太多了，生信领域各种专业、精心注释的数据库，都属于2级的研究。2级比1级高的地方，在于1级只能帮助一个实验室或者固定的、极有限的合作者，而2级的工作则可以帮助数百甚至数千的生物学家。2级的工作不必须发表在顶级的期刊上，时间会证明一切，比如分子进化领域的经典软件MEGA，每年几千的引用跟玩儿一样。

3级（Level 3）：玩数据、作发现。简称：顶级。

3级的生信研究一般是整合公共的高通量数据，利用相当精致的方法来做出生物学发现。因此这样的工作一般是从数据开始，实验验证结束。这就需要生物信息学家具有非常扎实的生物学知识，并且能够自己提出有意思的生物学问题。生物信息学家可以领导一个生物学的项目，并且实验学的合作者能够相信预测的正确性以及意义，并乐意开展实验验证。这个级别的研究一般都需要实验验证，不然顶级的期刊不收。对这类工作的评价，主要是看生物学的问题是否有意思，数据整合和分析是否有足够的技巧和合理性，并且也可以根据杂志发表期刊的档次（影响因子）来判断。

X级（Level X）：玩科学、讲政治。简称：神级。

在这个级别，生物信息学家要在巨型项目产生的海量数据的整合和模拟中发挥关键作用。做这个级别工作的生物信息学家一般具有良好的1级和2级的研究记录，并且在团队研究中要具有非凡的领导才能。这些工作一般都发表在顶级的期刊，并且引用极好，在研究过程中要注意协调方方面面。尽管有时生信对于这些论文的发表是重要的，但往往数据本身可能比方法更重要。例如期刊判断论文要依据其数据量的大小以及潜在的引用，而不是生信。此外，这类工作更多的是反映第一作者老板们的领导力以及在领域里的地位，而不是第一作者的技术能力和创造力。所以X级论文的第一作者们往往并不会得到足够的认可。因此，这些工作中的一作在独立研究之后，往往是必须建立科学的声誉，并且与之前X级工作无关。学者参加一些X级的生信研究无可厚非，因为这些项目的成员一般在各自领域都是顶级学者。但如果学者只开展或者只发表X级的工作，那就表明该学者在政治方面的关注已经超过科学了。

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