小故事

据说在亚细亚的一座古城里，有一辆古代皇帝遗留的战车，车辕上有一个十分复杂的结子，谁能解开它谁就能征服亚细亚。一时间，很多企图得到亚细亚的人都试图来解开它，但很多天过去了，没有人成功。有一天，马其顿国王亚历山大经过这里时，也尝试着去解开它，同其他人一样他也失败了，于是他抽出剑将这个结子一劈两半，说:“管他什么结子，让亚细亚在我的剑下屈服吧!”很多人以为这个看似复杂的结子只有用复杂的方法才能解开，结果想尽了办法却没有成功，而亚历山大却用一个最简单的方法一一将其劈开。

奥卡姆思想

Do not multiply entities beyond necessity, but also do not reduce them beyond necessity.

如无必要，勿增实体

其实就是一种比较优化的思考方式

万事套路能少就少

结论

复杂的事情不一定要用复杂的方式解决，相反最简单的方式也许最有效。

最大简约法

最大简约法（Maximum parsimony）是一种常使用于系统发生学分析的方法，根据离散型性状包括形态学性状和分子序列（DNA，蛋白质等）的变异程度，构建生物的系统发育树，并分析生物物种之间的演化关系。

简单讲就是进化过程应该是简单的，没有太多的变异和套路。

基于简约性原则：所发生的突变和替换越少，越真实，越简单越真实，套路越s少越真实。

也就是说我们在考虑物种之间进化关系的时候，不要自己给自己设计难题，任务物种之间的进化存在太多的反复和复杂性，这样不能反映一般的规律，更一般的规律是最简约的方式是物种进化的最优方式。

优点：不需要引入氨基酸替换模型。

缺点：当物种之间确实存在太多的回复突变和平行突变的时候（套路很多）还真搞不定。

构建进化树过程

如下图中，有4个物种，其中序列长度为9。其中5、7、9为信息位点（就是有效信息点）。

以5信息位点为例。我们对1、2、3、4进行分类。

TREE1中是1和2为一类，3和4为一类，然后1、2的父节点和3和4的父节点相连。树型为TREE1。

我们会发现。

这样的话。

我们认为1和2的父节点也是G。3和4的父节点也是A。

我们如何按TREE1分类就是承认在父节点之间发生了一次A和G的替换。

同理TREE2中的树形承认了父节点和1之间、2之间存在两次替换。

同理TREE3中是存在2次。

根据我们的简约原则，我们认为TREE1最能最真实的反馈进化关系。

结论

最大简约法是进化生物学研究中重要的分析方法，其原则对于处理复杂的生物演化过程有重要意义，我想我们不仅要理解最大简约在构建进化树的思想和应用。在生活和学习中，也应该多利用它给予的智慧和力量。

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