目前市面上有很多生信使用的教材，大多偏重于理论，或者偏重于实践，很少有能将两者结合起来的书籍。

去年市场上出了一本书。

看封面其貌不扬

但是里面内容还是很干的，完全可以用来作为入门的生信操作手册。

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前方高能

目录1测序技术进展1.1绪论1.2测序技术发展历程1.2.1发展中的DNA测序技术1.2.2经典的DNA测序方法1.3Sanger测序技术的原理和流程1.3.1Sanger测序技术的原理1.32Sanger测序技术流程1.3.3影响DNA测序的因素1.4测序常见问题及分析1.4.1PCR产物测序套峰1.4.2测序没有信号1.4.3测序反应提前终止1.5Sanger法测序的应用领域1.5.1DNA测序1.5.2功能强大的片段分析1.5.3SNP研究1.6第二代测序技术1.6.1第二代测序技术的特点1.6.2第二代测序技术原理1.6.3第二代测序技术的应用1.6.4第二代测序技术比较1.6.5第二代测序技术存在的问题1.6.6第二代测序技术发展及展望1.7第三代测序技术1.7.1Heliscope单分子测序1.7.2单分子实时测序技术1.7.3纳米孔单分子技术1.7.4第三代单分子测序技术的应用2高通量测序实验技术2.1denovo测序实验2.1.1denovo测序介绍2.1.2实验设计2.1.3基因组DNA的提取2.1.4文库构建2.2重测序实验2.2.1重测序介绍2.2.2重测序常用实验方法2.2.3实验设计2.2.4文库构建2.2.5重测序技术的应用2.3转录组测序实验2.3.1转录组与转录组学介绍2.3.2实验设计2.3.3文库构建2.3.4验证实验2.4宏基因组测序实验2.4.1宏基因组学背景介绍2.4.2方案设计2.4.3常见环境微生物样本制备及DNA提取方法2.4.4文库构建2.4.5宏基因技术的应用2.5microRNA测序实验2.5.1microRNA介绍2.5.2实验设计2.5.3文库构建2.5.4体外实验功能验证2.5.5体内实验验证2.6IncRNA测序实验2.6.1IncRNA介绍2.6.2IncRNA实验设计2.6.3rRNA去除2.6.4文库构建2.6.5IncRNAPCR（多基因或单基因验证）2.6.6IncRNA的荧光原位杂交（FISH）2.7目标区域测序实验2.7.1目标区域测序简介2.7.2目标区域测序捕获平台2.7.3目标区域测序的实验流程2.8表达谱测序实验2.8.1表达谱测序技术介绍2.8.2实验设计2.8.3RNA提取和质量检测2.8.4Tag标签制备及测序2.8.5DGE差异表达基因的验证2.8.6表达谱测序的主要用途2.8.7目标基因cDNA全长克隆2.8.8荧光定量（RT—PCR）2.9甲基化测序实验2.9.1DNA甲基化简介2.9.2实验设计2.9.3甲基化DNA免疫共沉淀测序（MeDIP—Seq）2.9.4测序文库构建2.9.5甲基化验证实验3生物信息分析环境构建3.1高性能计算环境概述3.1.1高性能计算的发展3.1.2高性能集群综合解决方案3.2生物信息分析环境搭建3.2.1硬件配置3.2.2系统安装3.2.3系统配置3.2.4生物软件安装3.2.5生物数据库安装3.2.6流程搭建3.3生物信息云平台构建及应用3.3.1云计算平台概述3.3.2生物信息云计算平台发展沿革3.3.3生物信息云平台构建3.3.4生物信息云平台应用3.3.5生物信息云计算平台产品案例3.3.6生物信息云计算平台产业发展3.4生物信息分析常用资源3.4.1NCBI与核酸相关数据库3.4.2蛋白质相关数据库3.4.3GeneOntology数据库3.4.4KEGC数据库3.4.5生物学数据库搭建3.5生物信息分析常用的软件3.5.1生物数据查看与编辑软件3.5.2基于Linux服务器与高性能平台分析软件3.5.3高通量测序数据质控软件3.5.4序列比对软件3.5.5基因组数据拼接软件3.5.6变异检测与注释软件3.5.7转录组分析软件3.5.8R语言4高通量测序数据生物信息分析4.1高通量测序的生物信息学分析概述4.1.1高通量测序数据分析的软硬件条件4.1.2高通量测序数据分析通用流程4.2基因组denovo测序数据分析4.2.1denovo测序概述4.2.2生物信息分析策略4.2.3案例展示4.2.4细菌基因组denovo测序拼接流程详解4.3基因组重测序数据分析4.3.1重测序数据分析概述4.3.2重测序数据分析流程4.3.3重测序数据分析实践4.4转录组测序数据分析4.4.1转录组数据分析概述4.4.2转录组测序数据基本分析4.4.3转录组拼接4.4.4鉴定长非编码RNA4.4.5鉴定环状RNA4.4.6差异表达分析4.4.7蛋白结合分析4.4.8RNA结构分析4.4.9调控网络分析4.4.10转录组数据分析典型案例4.4.11转录组测序数据分析实践4.5宏基因组数据分析4.5.1宏基因组数据分析概述4.5.2宏基因组数据分析策略4.5.3基于16SrDNA／18SrDNA／ITS靶向测序数据分析流程4.5.4基于靶向测序数据分析典型案例4.5.5宏基因组测序数据分析流程4.5.6宏基因组测序数据分析典型案例4.6miRNA测序数据分析4.6.1数据分析流程4.6.2数据分析典型案例4.6.3miRNA测序数据分析实践4.7外显子组测序数据分析4.7.1外显子测序概述4.7.2外显子组测序数据分析流程4.7.3外显子组测序数据分析典型案例4.7.4外显子组删序在疾病研究中的应用4.7.5目标区域测序4.8DNA甲基化测序数据分析4.8.1DNA甲基化概述4.8.2甲基化DNA免疫共沉淀测序4.8.3甲基化数据分析示例4.8.4全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）4.8.5简化重亚硫酸盐测序4.9染色质免疫共沉淀测序（ChIP—Seq）数据分析4.9.1ChIP—Seq概述4.9.2ChIP—Seq数据分析流程4.9.3Chip—seq数据分析实践

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