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网站链接

一　检索．

“生物信息学链接目录”针对分子资源，工具和数据库提供了有针对性的链接，其来源于“核酸研究”（NAR）期刊．

生物信息学链接目录包含分子资源，工具和数据库的的相关链接。 本目录中列出的链接是根据该领域生物信息学专家的建议进行选择的，还依靠我们社区的生物信息学用户的意见建议。 从2003年开始，开始列出NAR Webserver问题中包含的所有链接。

直接在检索框输入检索内容即可．

二　具体分类

括号中为资源数目

１计算机相关（85）

此类别包含与生物信息学中常用的编程语言相关的资源链接。其他相关工具，如Web开发和数据库资源，也包括在这里。

Bio-* Programming Tools

C/C++

Databases

Java

Linux/Unix

Math and Statistics

PERL

PHP

Web Development

Web Services

Workflows

2 DNA（604）

该类别包含有关DNA序列分析的有用资源的链接，例如用于序列比对分析和序列组装的工具。序列操作，引物设计，序列检索和提交工具的链接也列在这里。

Annotations

Databases

DNA and Genomic Analysis

Gene Prediction

Mapping and Assembly

Methylation Analysis

Phylogeny Reconstruction

Sequence Polymorphisms

Sequence Retrieval and Submission

Structure and Sequence Feature Detection

Tools For the Bench

3 教育（75）

生物信息学领域有关技术，材料，人物，地点和事件的信息。包括现在的新闻头条，文学来源，教育材料以及生物信息学课程和研讨会的链接。

Bioinformatics Related News Sources

Community

Courses, Programs and Workshops

Directories and Portals

General

Tutorials and Directed Learning Resources

4 表达（396）

链接到用于预测基因表达，选择性剪接和调节的工具。本部分还包含有关蛋白质表达，SAGE，EST和微阵列数据的数据库，方法和分析工具的链接。

cDNA, EST, SAGE

Databases

Gene Regulation

Gene Set Analysis

Networks

Protein Expression

Splicing

Transcript Expression Analysis

5 人类基因组（240）

本节包含除序列多态性和基因组学资源，还有人类基因组注释的链接。还包括与围绕人类基因组研究的伦理讨论相关的链接。

Annotations

Databases

Ethics

Genomics

Health and Disease

Other Resources

Sequence Polymorphisms

6 文献（87）

与已发表文献相关资源的链接，包括搜索文章和文献摘要的工具。还列出了附加文本挖掘资源，开放获取资源和文献数据库。

Databases

Goldmines

Open Access Resources

Search Tools

Text Mining and Semantics

7 模式生物（378）

这一类别包括从哺乳动物到微生物的各种模式生物体的资源链接。这些包括用于基因组尺度分析的数据库和工具。

Databases

Fish

Fly

General Resources

Microbes

Mouse and Rat

Other Organisms

Other Vertebrates

Plants

Worm

Yeast

8 其他分子（117）

与DNA，RNA和蛋白质以外的分子相关的生物信息学工具。该类别将包括小分子以及其他生物聚合物（包括碳水化合物和代谢物）的生物信息学的资源。

Carbohydrates

Compounds

Databases

Enzymes

Metabolites

Peptides

Small Molecules, Immunoglobulins

9 蛋白质（1007）

该类别包含用于蛋白质序列和结构分析有用资源的链接。系统发育分析的资源，蛋白质特征的预测和相互作用的分析也在这里找到。

2-D Structure Prediction

3-D Structural Features

3-D Structure Comparison

3-D Structure Prediction

3-D Structure Retrieval/Viewing

Annotation and Function

Biochemical Features

Databases

Do-it-all Tools for Protein

Domains and Motifs

Identification, Presentation and Format

Localization and Targeting

Molecular Dynamics and Docking

Networks & Interactions, Pathways and Enzymes

Phylogeny Reconstruction

Protein Expression

Proteomics

Sequence Comparison

Sequence Data

Sequence Features

Sequence Retrieval

10 RNA（203）

资源包括链接到序列检索程序，结构预测和可视化工具，主题搜索程序和关于各种功能性RNA的信息。

Databases

Functional RNAs

General Resources

Motifs

Sequence Retrieval

Structure Prediction, Visualization, and Annotation

11 序列比较（271）

用于比较序列（核酸或蛋白质）的工具和资源，包括序列相似性检索，比对工具，分类和一般比较基因组学资源。

Alignment Editing and Visualization

Analysis of Aligned Sequences

Comparative Genomics

Multiple Sequence Alignments

Other Alignment Tools

Pairwise Sequence Alignments

Similarity Searching and Classification

三　具体介绍

打开某一个分类会出现具体软件资源介绍，如下例子：动物转录因子数据库，会有该数据库介绍及参考文献文献．

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