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技术路线1.公共数据库获取癌症表达数据,获取COVID-19相关
基因。 2.差异表达分析筛选差异
基因DEG,与COVID-19相关
基因取交集作为CAN/COVID-19 Gene。
3.临床病理分析
4.
网络药理学识别候选药物(参考文献3)。4.1.蛋白互作
网络构建(基于drugbank,蛋白互作数据库,CAN/COVID-19 Gene构建互作网络)。
4.2.药物与肿瘤网络接近度分析,获取潜在药物(计算公式参考文献,结果排序,优先选择最显著的1-3个药物进行后续分析,注意,如果这部分结果不好,则考虑到drugbank COVID-19板块选择候选药物进行后续分析)。
5.候选药物靶点识别,与CAN/COVID-19 Gene交集分析
6.交集基因功能富集分析。 7.核心基因识别
8.药物与核心基因结合分析
9.药物-CAN/COVID-19综合调控网络构建
四、 参考文献1. Cancer patients in SARS-CoV-2 infection: a nationwide analysis in China2. Network Pharmacology and bioinformatics analyses identify intersection genes of niacin and COVID-19 as potential therapeutic targets3. Screening novel drug candidates for Alzheimer’s disease by an integrated network and transcriptome analysis
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