趋化因子为何能成为肿瘤免疫治疗靶点?生信分析为你揭秘

admin 16 2025-01-29 编辑

哈喽,小伙伴们,作为科研人的你,是不是还在为想不出新的idea苦苦思索,是不是还在为高分文章而频频脱发。今天,小编为大家介绍一个具有发表高分文章潜力的研究热点——趋化因子,走过路过不要错过,快来瞅瞅呐!

 

小编主要从以下三个方面介绍:

1、什么是趋化因子

2、趋化因子与肿瘤具有什么关系

3、为何利用生物信息分析趋化因子

 

什么是趋化因子?

趋化因子是一组低分子量(约8~12kDa)的细胞因子,调节免疫细胞的运输与分化,是免疫系统功能行使的核心。基于其主要蛋白质结构的前两个半胱氨酸残基的位置,可分为4个不同的亚家族:C、CC、CXC、CX3C。基于其功能,可分为内稳态趋化因子和炎症趋化因子。

 

主要功能

器官发育:在器官发育和血管生成过程中引导干细胞迁移到适当的位置;介导细胞增殖;介导淋巴细胞的成熟。

免疫监视:介导免疫细胞在健康外周组织中的稳态,维持免疫耐受。

组织更新再生:引导干细胞和祖细胞迁移,以促进损伤后的组织更新或再生;促进愈合过程中的血管生成;促进上皮、内皮、间充质的愈合。

宿主防御:促进先天免疫细胞募集至感染部位,防止微生物传播;调节适应性免疫反应,包括免疫激活和免疫记忆;调控效应细胞功能和在外周组织的存活。

 

趋化因子与肿瘤具有什么关系?

多数研究已经确定趋化因子及其同源趋化因子受体在癌症进展和治疗结果中发挥作用,参与肿瘤生长、存活、肿瘤细胞转移和血管生成。今年发表在Science Immunology上的一篇文章CXCL9 and CXCL10 bring the heat to tumors(IF 30+)重点介绍了趋化因子CXCL9和CXCL10与肿瘤的关系,文章表示促进免疫细胞向肿瘤募集的一个主要因素是趋化因子的产生,CXCL9和CXCL10的产生是T细胞浸润的一个重要组成部分,可激发趋化因子网络和“热”肿瘤微环境。因此,促进产生这些趋化因子的髓细胞的招募的治疗干预措施,以及触发产生这些趋化因子的先天免疫途径激活因子,有可能在临床中广泛扩大免疫治疗的疗效。

 

 

为何利用生物信息分析趋化因子? 

Pubmed检索“chemokines”,近10年有67001篇文章,其中review 7830篇,文章数量是逐年上升的()。Pubmed检索“(chemokines) AND (bioinformatics)”,近10年仅有2774篇文章,文章数量也是逐年上升的()。可见,利用生物信息分析趋化因子是很有价值的。

 

关注趋化因子研究的小伙伴们机会来了~

在不同类型的趋化因子中,CXC趋化因子在肿瘤发生中的作用最为显著。刚刚简单的为大家介绍了趋化因子与肿瘤的关系,那么怎么利用生物信息分析趋化因子呢?小编找到了一篇趋化因子的生信综合分析文章,最适合大家参考。文章于今年4月发表于BMC Medical Genomics杂志(IF:3.622)。

 

 研究背景

胰导管腺癌(PDAC)是一种高致死率的恶性肿瘤,占胰腺癌的85%以上。2020年,癌症统计数据显示,与胰腺癌相关的新增病例为60430例,死亡病例为48220例。在过去的十年中,在晚期疾病的诊断和治疗方面取得的进展只在患者预后方面取得了有限的增量进展。患者生存时间未明显延长,预后较差,5年生存率低于10%。这些数据说明迫切需要对PDAC进行创新治疗。

 

CXC家族的趋化因子(CXCL1-CXCL17)是小的(8~10 kDa)分泌蛋白,对炎症和抗肿瘤免疫至关重要。结直肠癌的研究表明,肿瘤微环境(TME)中的趋化因子经常发生改变,从而影响肿瘤的增殖和转移。李煜等人系统分析了结直肠癌中CXC趋化因子的表达及预后价值,发现CXCL1、CXCL2、CXCL3、CXCL5和CXCL8的表达增加,提示它们可作为潜在的治疗靶点和预后因素,并参与抗肿瘤免疫应答。研究还表明,CXC趋化因子可导致癌症的促进或抑制,这主要取决于抑制或刺激免疫系统作用的能力。然而,PDAC中CXC趋化因子的作用尚未阐明。因此,在本研究中分析了CXC趋化因子家族的mRNA表达及其与PDAC特征的相关性。进一步阐明了胰腺癌TME中CXC趋化因子与免疫细胞浸润的相关性,提高PDAC患者的治疗方案和预后的准确性,为PDAC的预后生物标志物和治疗靶点提供更多的数据。

 

研究方法

1、表达分析

2、生存分析

3、基因突变,共表达和相互作用分析

4、癌症相关途径及药物敏感性分析

5、富集分析

6、免疫浸润分析

7、免疫检查点相关性分析

 

研究结果:

1、  PDAC中CXC趋化因子表达

 

2、CXC趋化因子在PDAC中的预后价值

3、PDAC中CXC趋化因子的基因改变、共表达、相互作用分析、癌症相关途径及药敏分析

4、PDAC中CXC趋化因子的富集分析

 

 

5、PDAC中CXC趋化因子免疫浸润分析、免疫检查点的相关性分析

 

 

 

总结:

文章通过对PDAC中CXC趋化因子的表达分析、生存分析、基因突变、共表达和相互作用分析、癌症相关途径和药物敏感性分析、富集分析、免疫浸润分析和免疫检查点分析,为CXC趋化因子的表达及其在PDAC免疫微环境中的作用提供了新的见解,为PDAC的预后生物标志物和治疗靶点提供更多的数据。

 

那么趋化因子在其它癌症中的免疫微环境中是否也发挥作用呢?答案是肯定的。另外,趋化因子在其它人类疾病中同样起到重要作用,例如HIV感染、心血管疾病等。生物信息结合趋化因子的文章立意及创新思路是具有挖掘价值的,有想法的小伙伴们快快行动起来吧!

 

 

趋化因子为何能成为肿瘤免疫治疗靶点?生信分析为你揭秘

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