一个低调奢华有内涵的单基因分析思路

admin 3 2025-02-06 编辑

许久没有推出单基因分析思路了,很多粉丝常常会问到特定的单基因可以做什么思路,根据小编的经验来看单基因的思路是比较少的,很多都是发现调控轴然后做实验验证就完活了。因为研究的单一,能做的生信分析真的是很少很少,是真的不好分析,许多时候小编也是对此黔驴技穷,但是单基因分析接收率是真的高,因为专一嘛。今天的思路还挺别出心裁的,根据研究单个基因的互作基因来展开分析,小凳子搬好,开讲了。

免疫检测位点相关的4-gene signature 预测低级别胶质瘤预后”,乍一看这题目真的跟单基因没什么关系哈,没事慢慢来

流程图:

有点长哈说明做的分析还是不少的,逻辑清楚易懂,看完应该都知道做了点啥东西了

具体内容:

1、选择你感兴趣的基因,多数据集给审稿人分析我为啥要做这个基因,秘诀是数据集越多越好。秉承优良的传统:分析不够数据来凑(这不是讨巧的方式哦,概率越大越靠谱嘛😁)

2、重点来了,筛选你要做的基因的互作基因(小编认为你还可以根据相关性、调控关系等方式筛;筛什么呢,你感兴趣的比如:TF、miRNA、lncRNA、自噬基因等等,天马行空的放飞你的脑洞就行(一定要有理有据哈))做个功能、通路分析

嗯,缺个预后分析

对,我很无趣,那再做个预后signature,低级别胶质瘤数据集多,任性再做个验证(就是这么朴实无华有内涵😝)

3、前面的分析还是远远不够的,不行我要升华一下让审稿人看见我的低调奢华有内涵。研究基因的嘛,LGG呀肯定离不开IDH突变,表达结合临床特征来一波

要让审稿人发现我的美,1p/19q联合缺失也不能少

4、肿瘤分析怎么能少得了免疫check位点呢,虽然我没有免疫治疗数据集可用,我也得分析一下,探索探索呀,让审稿人看到我难能可贵的探索精神,分析和验证集都整上!

5、GSEA加把验证的小火苗点亮审稿人的小心心😘

6、分析总得应用于临床,构建列线图走起

看到这,审稿人已经给绿色通道了。小编觉得能加的东西还有很多很多比如浸润、突变等,就不一一列举了。如果你有感兴趣正在研究的单基因或者已经做了湿实验缺少生信分析,苦于无思路的,记得扫码联系我们的可爱小姐姐,明天见!

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